SSR-PCR

作品数:143被引量:583H指数:15
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中国沙棘SSR-PCR反应体系的优化及引物开发被引量:1
《基因组学与应用生物学》2023年第10期1038-1049,共12页刘青青 马玉花 李雄杰 马福林 高佩 马亚琼 杨开宇 
国家自然科学基金项目(31660071);青海省科技厅项目(2017-ZJ-734)。
本研究旨在建立适宜中国沙棘(Hippophae rhamnoides subsp.sinensis)SSR-PCR的反应体系,以期为中国沙棘遗传多样性分析、种质资源鉴定等相关研究奠定基础。本研究以来自青海不同地区的中国沙棘野生种的150个植株为试验材料,采用单因素...
关键词:中国沙棘 SSR-PCR 单因素试验 正交试验 
云南白灵芝菌株分子鉴定及SSR遗传多样性分析被引量:8
《分子植物育种》2022年第19期6415-6423,共9页姚春馨 陈卫民 柴红梅 田果廷 
云南省重大科技专项(202102AE090051-2-02);云南省乡村振兴科技专项(202204BP090023)共同资助。
为了在分子水平上明确云南白灵芝的种属地位和遗传差异,本实验利用rDNA-ITS序列比对和SSR分子标记法,对云南白灵芝菌株进行分子鉴定和遗传多样性分析。结果显示,15个菌株的ITS测序在种的水平上鉴定为白肉灵芝(Ganoderma leucocontextum)...
关键词:白肉灵芝 RDNA-ITS SSR-PCR 分子鉴定 
西北地区大蒜及其野生蒜SSR-PCR体系优化及引物筛选被引量:1
《江苏农业科学》2022年第18期274-279,共6页李守明 史荣梅 李辉玲 
新疆维吾尔自治区自然科学基金(编号:2021D01B27)。
为探索了解西北地区大蒜及其野生蒜资源之间的亲缘关系及变异特性,以25份西北地区及野生大蒜鳞茎和叶片为材料提取模板DNA,筛选适于简单重复序列(SSR)-PCR的反应体系。采用L_(16)(4^(3))正交表设计正交试验并进行单因素试验,对影响大蒜S...
关键词:大蒜 SSR-PCR 优化反应 引物筛选 扩增产物 
极小种群野生植物十万大山苏铁SSR和ISSR反应体系建立及引物筛选被引量:4
《分子植物育种》2022年第8期2689-2698,共10页秦惠珍 杨秀德 唐健民 邹蓉 朱成豪 韦霄 蒋运生 熊忠臣 唐凤鸾 
广西自然科学基金面上项目(2020GXNSFAA259029);中央引导地方科技发展专项(桂科ZY1949013);广西植物研究所所基本业务费(桂植业18013;桂植业18014)共同资助。
为筛选出适用于极小种群野生植物十万大山苏铁的SSR引物和ISSR引物,建立十万大山苏铁的SSR-PCR和ISSR-PCR反应体系,本研究以十万大山苏铁为试验材料,用改良CTAB法提取其基因组DNA,采用L_(16)(4^(3))正交设计方法,探索2×Taq Mix、引物...
关键词:十万大山苏铁(Cycas shiwandashanica) 反应体系 ISSR-PCR SSR-PCR 引物筛选 
无芒雀麦SSR-PCR反应体系优化及其遗传多样性分析被引量:2
《基因组学与应用生物学》2021年第11期3600-3609,共10页于金田 常巍 高雪芹 伏兵哲 
宁夏回族自治区农业育种专项(2019NYYZ0403);宁夏回族自治区重点研发计划(重大)重点项目(2019BBF02022);草学一流学科建设项目(NXYLXK2017A01)共同资助
为分析无芒雀麦(Bromus inermis)遗传多样性及对其进行分子标记开发利用,采用正交设计建立SSR-PCR扩增最优体系,通过多态性、相似系数和聚类等分析方法对16份无芒雀麦种质材料的遗传多样性进行分析,结果表明:无芒雀麦SSR-PCR扩增最佳反...
关键词:无芒雀麦 SSR分子标记 体系优化 遗传多样性 
元宝枫SSR-PCR反应体系优化及引物筛选被引量:4
《分子植物育种》2021年第7期2279-2285,共7页燕丽萍 王因花 吴德军 任飞 李庆华 姚俊修 
山东省林业科技创新项目(2019LY001-3)资助。
本研究采用改良的CTAB法提取元宝枫基因组DNA,并使用L16(45)正交试验设计。通过5因素4水平实验,筛选Taq DNA聚合酶、dNTPs、引物浓度、Mg2+、模板DNA浓度及其用量,建立并优化元宝枫(Acer truncatum)的最佳SSR-PCR反应体系,即总体积20μL...
关键词:元宝枫 正交设计 引物筛选 
华重楼灰霉病菌灰葡萄孢ITS分型及SSR遗传多样性分析被引量:2
《菌物学报》2021年第3期566-579,共14页王帆帆 唐涛 曾佳 郭杰 唐其 郭晓亮 段媛媛 游景茂 
国家中药材产业技术体系(CARS-21);湖北省民族专项(2018AKB037);湖北省农业科学院扶持性计划(2019fcxjh09);湖北省农业科学院中药材研究所青年科学基金(2019ZYCJJ01);湖北省农业科学院青年基金(2020NKYJJ20);湖南省教育厅重点项目(17A093)。
华重楼灰霉病在湖北和湖南两省多有发生,已对华重楼药材生产构成了严重威胁。为明确该病菌的遗传多样性水平,本研究对分离自两省10个地区的92株华重楼灰霉病菌进行了rDNA-ITS分子鉴定,同时采用SSR-PCR技术进行了遗传多样性分析。rDNA-IT...
关键词:灰葡萄孢 RDNA-ITS SSR-PCR 遗传结构 聚类分析 
苹果SSR-PCR反应体系的建立与优化被引量:2
《中国农学通报》2021年第1期61-66,共6页刘琳 孙晓帅 李乾 范书臣 时鸿迪 马钧 刘丹丹 
云南省科技计划“云南特色水果品质提升与优势品牌创建”(2019ZG002);国家自然科学基金“苹果砧木平邑甜茶PcG蛋白MhMSI1调控单性生殖的分子机理”(31660566)。
为建立苹果属植物SSR-PCR反应优化体系,采用L16(45)正交实验和退火温度梯度实验,分析反应体系中使用的模板、引物、Mg2+、dNTPs以及Top Taq酶浓度对扩增产物的影响,并对这5个因素进行4个水平不同浓度梯度的筛选和优化。结果表明,引物浓...
关键词:苹果 SSR-PCR最佳反应体系 正交设计试验 种质资源 单因素试验 
木本油料植物光皮树SSR特征分析及其SSR-PCR反应体系优化被引量:3
《分子植物育种》2020年第24期8155-8162,共8页周宵 彭映辉 蒋丽娟 陈景震 王明怀 何祯祥 陈勇 康向阳 张良波 
湖南省重点研发计划项目(2018NK2044,2017WK2021);国家外国专家项目计划(GS20190129002);长株潭国家自主创新示范区专项(2018XK2005);国家光皮树山苍子良种基地良种繁育补助项目(湘财资环指(2019)15号)共同资助。
本研究基于木本油料植物光皮树叶片转录组数据,利用软件MISA (1.0)对所有Unigene进行SSR搜索、检测和特征分析。结果显示,光皮树叶片转录组36 839条Unigene,有8 945条Unigene含有SSR。一共有SSR位点12 538个,出现频率约为2 514 bp/个。...
关键词:木本油料植物 转录组 特征分析 SSR PCR反应体系 
流苏树属SSR-PCR反应体系的建立与优化被引量:1
《基因组学与应用生物学》2020年第11期5247-5254,共8页李晓 张鸽香 
国家林业局948项目美国流苏优良种质繁育技术引进(2014-4-17);江苏高校品牌专业建设工程资助项目(PPZY2015A063)共同资助。
本研究先采用单因素试验确定5个影响因素的浓度区域,然后进一步进行正交试验筛选各因素最优水平,通过两种实验方法相结合,优化、建立流苏树属(Chionanthus)SSR-PCR反应体系,最后检测其稳定性。研究结果表明,优化后的20μL流苏树属SSR-PC...
关键词:流苏树属(Chionanthus) SSR-PCR 影响因子 反应体系优化 
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