基于Illumina高通量测序技术分析草莓表面微生物结构  

Analysis of surface microbial flora structure of strawberry based on Illumina high-throughput sequencing technology

作　　者：戴宝玲 肖英平[2,3] 戴贤君 何祥祥 王佩佩[2] 杨华[2,3] 

机构地区：[1]中国计量大学生命科学学院,浙江杭州310018 [2]浙江省农业科学院农产品质量标准研究所,浙江杭州310021 [3]浙江省植物有害生物防控省部共建国家重点实验室培育基地,浙江杭州310021

出　　处：《江苏农业科学》2018年第20期25-28,共4页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：浙江省植物有害生物防控重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地项目(编号:2010DS700124-ZM1608)

摘　　要：为了解不同基地草莓表面微生物的结构特点,在浙江省8个草莓生产基地采集草莓样本,并提取表面微生物DNA样本,利用特异性的引物分别对细菌16S rRNA基因的V3~V4区进行PCR扩增,然后基于Illumina高通量测序技术分析不同基地草莓微生物的菌群结构。结果表明,不同基地草莓表面微生物在门的水平上主要包括变形菌门、厚壁菌门、蓝藻细菌门、放线菌门、拟杆菌门;在属的水平上,优势菌属主要为布赫纳氏菌属、甲基杆菌属和葡糖杆菌属,其中所检出的寡养单胞菌属、苯基杆菌属、埃希杆菌属和葡萄球菌属均具有一定的致病性。由此说明高通量测序技术应用于草莓表面微生物的分析,可在一定程度上提供草莓污染的病原菌信息。

关 键 词：草莓 菌群结构 高通量测序 病原菌 微生物检测 

分 类 号：S668.401[农业科学—果树学] S182[农业科学—园艺学]