43种植物CaM1基因密码子使用特征及遗传差异分析  

Analysis of codon usage characteristics and genetic difference of CaM1 gene in 43 plant species

作　　者：李晨辉 赵子捷 陈文烨 焦义然 杨帆[4] 刘永伟[4] 董福双[4] 杜进民[3] 周硕[4] Li Chenhui

机构地区：[1]河北菲尼斯生物技术有限公司,河北石家庄050035 [2]山西农业大学信息学院,山西太谷030800 [3]河北科技大学生物科学与工程学院,河北石家庄050000 [4]河北省农林科学院遗传生理研究所/河北省植物转基因中心,河北石家庄050051

出　　处：《江苏农业科学》2019年第5期28-32,共5页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家自然科学基金青年科学基金(编号:31600216);河北省自然科学基金青年基金(编号:C2017301066);河北省现代农业创新工程项目(编号:2019-4-8)

摘　　要：为深入了解不同类植物CaM1基因(calmodulin 1,简称CaM1)在抵抗逆境进化过程所形成的密码子的使用特征和遗传差异。运用CodonW、BioEdit和MEGA软件对43种植物序列进行分析,并构建系统发育树。结果表明,CaM1基因对密码子的使用具有极强的偏好性,CUC、AUC、UCU、CCA、ACU、UGA为其最优密码子,禾本目植物更偏好使用G/C碱基。G、C碱基含量和位置是引起CaM1基因密码子偏性的主要原因。遗传距离分析表明,山柑目与白花菜目之间的亲缘关系最近,豆目和无患子目间的亲缘关系次之,与聚类分析结果相符。

关 键 词：CaM1 密码子偏性 遗传距离 亲缘关系 

分 类 号：S188[农业科学—农业基础科学]