基于16S和COⅠ基因探讨岩扇贝在扇贝科中的分类地位  

Study on classification status of Crassadoma gigantea in Pectinidae based on 16S and COⅠ genes

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作  者:曹善茂[1] 朱丽洁 聂鸿涛 印明昊 刘钢[1] 邹建威 王尧 Cao Shanmao

机构地区:[1]大连海洋大学/辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室,辽宁大连116023 [2]大连海洋大学水产与生命学院/辽宁省贝类良种繁育工程技术研究中心,辽宁大连116023 [3]辽宁省大连市海洋与渔业局,辽宁大连116023

出  处:《江苏农业科学》2019年第7期28-31,共4页Jiangsu Agricultural Sciences

基  金:辽宁省海洋与渔业厅项目(编号:201214);辽宁省大连市海洋与渔业局项目(编号:2012011)

摘  要:采用PCR扩增和序列测定等技术,对岩扇贝(Crassadoma gigantea)线粒体DNA 16S rRNA和COⅠ基因片段进行初步研究,得到16S rRNA基因片段的大小在613.0~634.0 bp之间,A、T(U)、G、C的平均含量分别为26.5%、29.7%、24.5%、19.3%;COⅠ基因片段的大小为660 bp,碱基A、T、G、C的平均含量分别为17.2%、40.3%、27.2%、15.3%。16S基因在岩扇贝中偏好使用GUU、UUG、AUU、ACG、UAU、CAA、GAG、UUU、UCU、GAU、GGU、GAG、AGG和GGA等25个密码子。COⅠ系统进化树表明,与岩扇贝亲缘关系最近的是柿孔扇贝(Azumapecten farreri),其次是冰岛扇贝(Chlamys islandica)。16S系统进化树亲缘关系由近到远依次是北美扇贝(Patinopecten caurinus)、虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)、Chlamys islandica。

关 键 词:岩扇贝 COⅠ基因 16SrRNA 密码子偏好性 系统进化树分析 

分 类 号:S917.4[农业科学—水产科学]

 

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