基于多组学高通量数据分析乳腺癌中8号染色体开放阅读框33的表达和预后  

作　　者：张虎 杜欣娜[2] 凌存宝 陈根林 孙海燕 刘爽[2] 庄莹 

机构地区：[1]江苏医药职业学院基础医学部,江苏盐城224005 [2]佳木斯大学基础医学院 [3]江苏医药职业学院护理学院

出　　处：《中国老年学杂志》2019年第11期2628-2630,共3页Chinese Journal of Gerontology

基　　金：江苏省卫生计生委科研项目(No.Y2018101);江苏省高等学校自然科学面上项目(No.18KJB310002);江苏省“青蓝工程”项目(2016);江苏医药职业学院科技创新团队建设计划(No.20188104)

摘　　要：目的揭示乳腺癌组织中8号染色体开放阅读框(C8orf)33基因的表达及预后意义。方法利用cBioPortal门户网站分析C8orf33基因突变、拷贝数变化、mRNA水平变化、mRNA差异表达与预后关系,基因拷贝数畸变通过Oncomine分析乳腺癌组织与正常组织中C8orf33表达差异;利用多组学数据分析门户网站LinkedOmics分析浸润性乳腺癌组织中C8orf33基因表达与临床指标相关性及基因拷贝数畸变、甲基化水平与C8orf33表达的相关性。结果 cBioPortal分析结果显示,38%(417/1093)乳腺癌患者发生了C8orf33基因改变,包括基因扩增、缺失、错义突变和mRNA水平改变,其中C8orf33 mRNA水平上调占比34%,且C8orf33高表达不利于患者预后(P<0.01)。Oncomine结果显示乳腺癌组织中C8orf33表达显著高于正常乳腺组织(P<0.01);LinkedOmics结果显示浸润性乳腺癌患者中C8orf33表达水平分别受PAM50分子分型、组织学分型、肿瘤纯度和种族影响(均P<0.01);C8orf33 mRNA水平与其基因拷贝数畸变呈正相关(r=0.800,P<0.001),与其DNA甲基化水平呈负相关(r=-0.109,P<0.01)。结论乳腺癌中C8orf33基因拷贝数增加和低甲基化促进其高表达,C8orf33高表达不利于乳腺癌预后,可作为乳腺癌预后的候选标志物。

关 键 词：乳腺癌 8号染色体开放阅读框33 预后 拷贝数变化 甲基化 

分 类 号：R737.9[医药卫生—肿瘤]