MrBayes分子钟定年之程序(英文)  被引量:1

Molecular clock dating using MrBayes

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作  者:张驰 ZHANG Chi(Key Laboratory of Vertebrate Evolution and Human Origins of Chinese Academy of Sciences,Institute of Vertebrate Paleontology and Paleoanthropology,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100044;CAS Center for Excellence in Life and Paleoenvironment,Beijing 100044)

机构地区:[1]中国科学院古脊椎动物与古人类研究所中国科学院脊椎动物演化与人类起源重点实验室 [2]中国科学院生物演化与环境卓越创新中心

出  处:《古脊椎动物学报》2019年第3期241-252,共12页Vertebrata Palasiatica

基  金:supported by the 100 Young Talents Program of Chinese Academy of Sciences and partly supported by the Strategic Priority Research Program of Chinese Academy of Sciences (XDB26000000)~~

摘  要:介绍了利用MrBayes进行分子钟定年的研究概况和程序。利用一个整合分子序列和形态特征的膜翅目昆虫的数据,展示了两种现代方法:全证据定年和节点定年,并对这两种方法的相似点和不同之处进行比较和讨论。此外,还用无分子钟的方法对同一数据进行分析,并与分子钟定年法进行比较。This paper provides an overview and a protocol of molecular clock dating using MrBayes.Two modern approaches,total-evidence dating and node dating,are demonstrated using a truncated dataset of Hymenoptera with molecular sequences and morphological characters.The similarity and difference of the two methods are compared and discussed.Besides,a non-clock analysis is performed on the same dataset to compare with the molecular clock dating analyses.

关 键 词:贝叶斯系统发育推断 分子钟定年 马尔可夫链蒙特卡罗 MRBAYES 

分 类 号:Q91-3[天文地球—古生物学与地层学]

 

参考文献:

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