多重PCR引物在Xp11.2易位/TFE3基因融合中的应用  

Multiple PCR primers in the application of Xp11.2/TFE3 translocation detection

作　　者：叶胜兵 李锐[1] 夏秋媛[1] 王小桐[1] 王璇[1] 章如松[1] 时姗姗[1] 马恒辉[1] 陆珍凤[1] 饶秋[1] Ye Shengbing;Li Rui;Xia Qiuyuan;Wang Xiaotong;Wang Xuan;Zhang Rusong;Shi Shanshan;Ma Henghui;Lu Zhenfeng;Rao Qiu(Department of Pathology,Jinling Hospital,Nanjing 210002,China)

机构地区：[1]解放军东部战区总医院(原南京军区南京总医院)病理科,南京210002

出　　处：《中华病理学杂志》2019年第12期970-973,共4页Chinese Journal of Pathology

基　　金：国家自然科学基金面上项目(81872095)。

摘　　要：目的 对Xp11.2易位/TFE3基因不同融合类型设计多重PCR引物,证实多重PCR联合Sanger法测序的可行性,旨在探讨引物设计的重要性.方法 选取已通过高通量RNA-Seq测序证实TFE3融合类型的标本23例,其融合类型包括PSF-TFE3 3种,PRCC-TFE3 3种,ASPL-TFE3 2种, FUBP1-TFE3 1种,NONO-TFE3 2种,RBM10-TFE3 1种,MED15-TFE3 1种以及MATR3-TFE3 1种共计14种,对其用设计好的多重PCR引物进行PCR扩增并联合Sanger法测序进行验证,该次实验分4个多重PCR反应,包括14条不同基因的正向引物以及4条TFE3反向引物.结果 23例标本均与高通量RNA-Seq测序结果完全一致,可见所设计的引物通过多重PCR联合Sanger法测序是可行的.结论该方法的优势在于利用4个多重PCR反应便可确定是否存在上述14种TFE3融合类型阳性,并通过反向测序便可确定具体融合类型.因此从试剂成本方面考虑,尤其在大批量标本的TFE3融合类型筛查过程中,该方法较高通量RNA-Seq测序有很大的优势.

关 键 词：多重PCR 反向引物 引物设计 PCR引物 正向引物 

分 类 号：R73[医药卫生—肿瘤]