亚洲棉全基因组KNOX基因家族鉴定及组织表达分析  

Genome-Wide Identification and Expression Analysis of KNOX Genes Family in Gossypium arboreum

作　　者：孙润润[1] 王园园[1] 郭新磊 秦腾飞 张金宝[1] 金翠萍 董涛 王清连[1] Sun Runrun;Wang Yuanyuan;Guo Xinlei;Qin Tengfei;Zhang Jinbao;Jin Cuiping;Dong Tao;Wang Qinglian

机构地区：[1]河南科技学院,现代生物育种河南省协同创新中心,河南新乡453003 [2]中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081

出　　处：《中国棉花》2019年第12期15-22,共8页China Cotton

摘　　要：为探究亚洲棉KNOX基因家族特征及进化关系,本研究在石系亚1号中鉴定到23个KNOX基因(GaKNOX1-GaKNOX23)。23个基因定位于11条染色体上。除GaKNOX6、GaKNOX13、GaKNOX15、GaKNOX20和GaKNOX23外,其他GaKNOX蛋白均含有KNOX1、KNOX2、ELK和HOX 4个典型结构域。GaKNOX基因进化聚类形成两大分支:ClassⅠ和ClassⅡ。转录组数据分析显示,GaKNOX12在开花后20 d的纤维和胚珠中的表达量最高,说明它可能参与调控棉纤维次生壁形成过程。本研究在亚洲棉全基因组水平上鉴定KNOX基因家族并进行生物信息学分析,为进一步研究KNOX基因在棉花中的调控作用奠定基础。

关 键 词：亚洲棉 KNOX基因 进化分析 基因结构 组织表达 

分 类 号：R73[医药卫生—肿瘤]