大数据分析:利用R语言对乳腺癌HER-2免疫组化进行质量控制  

作　　者：汤永飞[1] 胡继昌[1] 黄亚冰[1] 袁静萍[1] 

机构地区：[1]武汉大学人民医院病理科,武汉430060

出　　处：《临床与实验病理学杂志》2020年第6期714-717,共4页Chinese Journal of Clinical and Experimental Pathology

基　　金：武汉市科技计划项目(2017060201010172);武汉大学人民医院引导基金(RMYD2018M27)。

摘　　要：目的利用R语言对乳腺癌HER-2免疫组化进行质量控制。方法收集武汉大学人民医院病理科2015年6月~2018年3月临床病理信息库中,同时行HER-2免疫组化和FISH检测的857例乳腺癌。利用R语言对数据信息进行提取,统计分析乳腺癌HER-2分布情况、乳腺癌病理组织分型的FISH分布、失控风险与检测时间的关系。结果基于R语言对数据进行提取、统计、分析,FISH检测结果:HER-2阳性率为29.7%,阴性率为68.7%,HER-2不确定率为1.6%;免疫组化HER-2(2+)的病例中,FISH阳性率为21.4%。免疫组化HER-2(3+)与FISH检测结果的一致率为98%。乳腺癌病理组织分型的FISH分布:乳腺浸润性导管癌阳性率为30.7%,阴性率为67.2%,不确定率为2.1%;乳腺导管原位癌+微小浸润的阳性率为73.7%,阴性率为26.3%;乳腺浸润性微乳头癌阳性率为53.3%,阴性率为46.7%。R语言还可统计失控风险与检测时间的关系,显示可能失控的病例,对病理医师具有警示作用。结论R语言作为一种开源的统计分析语言,其提供了丰富的数据统计和字符串处理功能,运用R语言可对HER-2免疫组化染色进行质量控制,寻找可能的失控点,以便查找原因,杜绝失控。

关 键 词：乳腺肿瘤 大数据 R语言 HER-2 质控 

分 类 号：R737.9[医药卫生—肿瘤]