利用TCGA数据库构建男性乳腺癌的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络  

作　　者：章锐 祝孔俊 杜秋丽[1] 袁媛[1] 阮剑[1] 赵建国[1] 

机构地区：[1]武汉市第一医院甲状腺乳腺外科,武汉430022

出　　处：《中国普外基础与临床杂志》2021年第3期380-384,共5页Chinese Journal of Bases and Clinics In General Surgery

基　　金：湖北省卫生健康委面上项目(项目编号:WJ2021M001)。

摘　　要：目的通过构建男性乳腺癌的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,探讨其发病机制。方法从TCGA数据库(The Cancer Genome Atlas Database)中下载男性乳腺癌的长链非编码RNA(lncRNA)、微小RNA(miRNA)和mRNA的表达谱数据,通过R软件的limma数据包分析男性乳腺癌差异表达的lncRNA、miRNA和mRNA;分析三者之间的靶向调控关系,构建ceRNA网络,并用Cytoscape软件可视化,并将差异表达基因进行GO富集和KEGG通路分析。结果男性乳腺癌中差异表达的lncRNA为275种,差异表达的miRNA为33种,差异表达的mRNA为1675种。本研究成功构建了男性乳腺癌的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络后,GO富集分析显示,差异表达mRNA参与细胞增殖的负调控、转录的负调控、细胞蛋白质代谢过程的调控、细胞迁移的调控、转移酶活性的正调控、间充质细胞增殖的正调控等。KEGG通路分析显示,差异表达mRNA参与癌症的途径、白细胞跨内皮迁移、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)和神经营养蛋白信号通路。结论本研究基于TCGA数据库成功构建了男性乳腺癌的ceRNA网络。

关 键 词：男性乳腺癌 长链非编码RNA 竞争内源性RNA网络 TCGA数据库 

分 类 号：R737.9[医药卫生—肿瘤] TP311.13[医药卫生—临床医学]