4种鬼伞β-1,3-葡聚糖转移酶的生物信息学分析  

Bioinformatics analysis ofβ-1,3-glucanosyltransferases in four coprinoid mushrooms

作　　者：牛鑫 柴倩囡 冯九海 单华佳 柯善文 汉佳昕 魏生龙 Niu Xin

机构地区：[1]河西学院甘肃省应用真菌工程实验室/甘肃省食用菌遗传育种重点实验室/祁连山食用菌产业协同创新中心,甘肃张掖734000 [2]河西学院生命科学与工程学院,甘肃张掖734000

出　　处：《江苏农业科学》2021年第6期33-39,共7页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：河西学院科研创新与应用校长基金(编号:XZ2017006);河西学院科研创新与应用校长基金专题(编号:XZZX2020006);甘肃省高等学校创新基金(编号:2020A-104);甘肃省引导科技创新发展专项资金(编号:2017zx-10)。

摘　　要：鬼伞是一类菌柄能在短时间内快速伸长并且伞盖易自溶形成墨汁的蘑菇,菌柄在伸长过程中细胞壁以伸长生长为主,细胞壁组分β-1,3-葡聚糖发生重构修饰,GH72家族的β-1,3-葡聚糖转移酶能够将较低聚合度的寡糖转化生成更高聚合度的糖链。β-1,3-葡聚糖转移酶可能参与鬼伞菌柄细胞壁中β-葡聚糖组分的重构修饰。以完成测序并有注释信息的灰盖拟鬼伞(Coprinopsis cinerea)、拟鬼伞(Coprinopsis marcescibilis)、晶粒小鬼伞(Coprinellus micaceus)和小脆柄菇(Psathyrella aberdarensis)等4种鬼伞的β-1,3-葡聚糖转移酶的氨基酸序列为基础,采用TargetP、WOLF PSORT、SignalP、Sompa、TMHMM 2.0、Big-PI Fungal Predictor、MEME和SISS-MODEL等生物信息学分析工具对其开展蛋白质亚细胞定位、细胞信号肽、二级结构、跨膜螺旋、糖基化磷脂酰肌醇(GPI)锚定位点、基序以及三级结构等进行分析,同时对上述序列开展遗传进化关系分析。研究结果可为进一步深入开展该蛋白在菌柄伸长过程中细胞壁β-葡聚糖组分的重构修饰研究作基础。

关 键 词：真菌细胞壁 菌柄伸长 Β-1 3-葡聚糖 细胞壁重构 多序列比对 生物信息学 

分 类 号：S188.3[农业科学—农业基础科学]