多序列比对

作品数：140被引量：286H指数：8
导出分析报告
相关领域：生物学农业科学更多>>
相关作者：张贵军邹权张化祥霍红卫李凤梅更多>>
相关机构：中国科学院西安电子科技大学华中科技大学哈尔滨工业大学更多>>
相关期刊：更多>>
相关基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划海南省自然科学基金更多>>
-
在结果中检索

检索结果分析

结果分析中...
共 条 记 录，以下是1-10
全选清除导出
参考文献引证文献引用追踪
视图：
排序：
基于报文匹配与GRU-ATT模型的协议逆向分析方法
《江苏科技大学学报(自然科学版)》2024年第6期76-82,共7页付饶 袁丁 刘琦 史晓桢 李丹奇 
国网江苏省电力有限公司科技项目(J2022014)。
针对未知网络协议逆向分析中的报文分类问题,提出了一种基于报文交互匹配与GRU-ATT模型的未知网络协议逆向分析方法MemProRe,结合多序列比对和深度学习方法,采用基于注意力机制的CNN-GRU-Attention网络,在客户端与服务器端交互报文集合...
关键词：协议逆向分析 多序列比对 报文交互匹配 门控循环单元 注意力机制 
新型冠状病毒Omicron RdRp的变异分析及其活性反应体系构建
《生物技术进展》2024年第6期1042-1054,共13页康茜 林姿妤 杨怡姝 李劲涛 王明连 
北京市自然科学基金资助项目(M22032)。
RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)在新型冠状病毒——严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)复制中发挥重要作用,是主要的抗病毒靶点。RdRp的功能严格依...
关键词：SARS-CoV-2 Omicron RDRP 多序列比对 分子对接 
基于Spark云计算的生物基因多序列比对方法
《计算机测量与控制》2024年第7期274-279,287,共7页杨波 陈洋广 徐胜超 
国家自然科学基金面上项目(61972444);广州华商学院校内科研导师制项目资助(2023HSDS34)。
在生物基因多序列比对过程中,早期的方法仅计算了单一的Spark集群参数,导致算法的并行效果较差;为此,设计了基于Spark云计算的生物基因多序列比对方法;基于获得的生物遗传序列数据,对其进行了优化,并通过计算不同序列间的匹配度,对生物...
关键词：Spark云计算 生物基因 生物信息学 基因多序列比对 并行算法 
一种面向生物基因多序列比对算法的任务调度方法
《计算机与现代化》2024年第7期7-12,共6页杨波 王宏杰 徐胜超 毛明扬 蒋金陵 蒋大锐 
国家自然科学基金面上项目(61972444);广州华商学院校内科研导师制项目(2023HSDS34)。
针对现阶段生物基因多序列比对算法在面对大规模数据时存在比对效率慢的问题,提出一种面向生物基因多序列比对算法的任务调度方法,以提高生物基因多序列比对的效率。通过Trie树方法对生物基因多序列数据展开分割处理,从而提高后续基因...
关键词：生物基因 任务调度 多序列比对 CPU与GPU BWT索引方法 
一个新的强化学习多序列对比工具CDRL被引量：1
《福建师范大学学报（自然科学版）》2023年第6期40-51,共12页王韦添 江育娥 
国家自然科学基金资助项目(61472082)。
多序列比对(multiple sequence alignment, MSA)在生物信息学中是一项重要的研究领域,常被用于描述物种之间的进化关系、药物设计和药物开发.MSA是一个NP完全问题,因计算过于复杂,无法获得最优解.强化学习方法在MSA中表现出了优异的性能...
关键词：多序列比对 强化学习 较大规模数据集 空间复杂度 上下文关系 
模式蓝藻FNR蛋白的生物信息学及进化分析
《河西学院学报》2023年第5期45-53,共9页殷亮 王代玮 韩雪雪 王丽娟 刘海燕 罗光宏 
甘肃省高等学校创新基金项目(项目编号:2020A-105);甘肃省重点研发计划-社发类(项目编号:21YF5FA129,22YF7FG188);甘肃省自然科学基金项目(项目编号:22JR5RG567);甘肃省科技计划项目基础研究计划(项目编号:22JR11RG222)。
FNR蛋白是蓝藻光能转换和能量代谢中的核心蛋白质,为了掌握该蛋白的生物信息学信息及其进化关系,选择具有研究和应用价值的7种模式蓝藻来源的FNR蛋白作为材料,以氨基酸序列为基础,采用ProtParam、Sompa、SWISS-MODEL及MEGA11等生物信息...
关键词：蓝藻 铁氧还蛋白-NADP+-氧化还原酶 生物信息学 多序列比对 进化分析 
基于协同变异与莱维飞行策略的教与学优化算法及其应用被引量：4
《计算机应用》2023年第5期1355-1364,共10页高昊 张庆科 卜降龙 李俊青 张化祥 
国家自然科学基金资助项目(62006144,62176144,61772322);山东省自然科学基金重大基础研究项目(ZR2019ZD03);山东泰山学者计划项目(ts20190924)。
针对教与学优化(TLBO)算法在处理优化问题时存在搜索不均衡、易陷入局部最优、综合求解性能弱等缺陷,提出一种基于均衡优化与莱维飞行策略的改进教与学优化算法ELMTLBO。首先设计精英均衡引导策略,通过种群中多个精英个体的均衡引导提...
关键词：教与学优化算法 均衡引导 莱维飞行 自适应权重 变异算子池 隐马尔可夫模型 多序列比对 
基于偏序图生成共识序列的改进星比对算法
《长江信息通信》2023年第1期1-4,共4页胡振铎 刘宇暄 朱晓 
国家自然科学基金资助项目(61902094);黑龙江省自然科学基金项目(QC2018082);黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划项目(UNPYSCT-2018183)。
多序列比对是生物信息学中十分常用的序列分析方法,主要用于分析分子进化关系、基因组分析、找出DNA序列之间的共同结构特征,从而准确判断序列结构和功能之间的具体联系。现今广泛使用的多序列比对方法主要分为渐进式比对和迭代式比对...
关键词：多序列比对 星比对算法 偏序图 共识序列 SIMD 
新冠病毒Omicron变异株S蛋白变异位点及进化分析
《计算生物学》2022年第4期59-65,共7页吴秀兰 李绮晴 郑珊丽 黄万信 钟华斌 唐文武 
新冠病毒Omicron变异株是2021年11月首次在南非发现,并已成为当前传染性最高的主流变异株,其传染性和S蛋白位点变异存在相关性。本文通过生物信息学方法对Omicron变异株的S蛋白变异位点进行分析,并与多种冠状病毒S蛋白进行多序列比对及...
关键词：S蛋白 变异位点 病毒感染性 冠状病毒 多序列比对 位点变异 序列保守性 靶向药物 
基于黏菌算法的蛋白质多序列比对被引量：5
《吉林大学学报（工学版）》2022年第12期2984-2993,共10页王鑫禄 刘大有 刘思含 王征 张丽伟 董飒 
国家自然科学基金重点项目(61133011).
基于黏菌算法(SMA)提出了一种有效的配比模型(SMA_MSA)以辅助判断不同序列之间是否具有同源性,进而预测蛋白质结构。基于BAliBASE 3.0基准数据集,对SMA_MSA和其他经典竞争算法在6类数据集上进行了测试。结果表明:在其中的31个数据集中SM...
关键词：计算机应用 蛋白质多序列比对 黏菌算法 BAliBASE 
全选清除导出
共14页<12345678910>
检索报告 对象比较 聚类工具 使用帮助 返回顶部