序列保守性

作品数：13被引量：60H指数：3
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相关机构：中山大学翌圣生物科技(上海)股份有限公司西北农林科技大学中国科学院更多>>
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基于机器学习的灵活链接肽位点预测方法研究
《科学技术创新》2023年第8期221-224,共4页邢倩 巩嘉贝 
灵活链接肽是固有无序蛋白和固有无序片段所具有的重要分子功能之一。为了对灵活链接肽这一功能位点进行预测,提出了以序列保守性和溶剂可及性为特征的支持向量机算法进行训练和预测的方法。从蛋白质的一级序列出发,以序列上邻近残基的...
关键词：灵活链接肽 功能位点 序列保守性 支持向量机 预测 
新冠病毒Omicron变异株S蛋白变异位点及进化分析
《计算生物学》2022年第4期59-65,共7页吴秀兰 李绮晴 郑珊丽 黄万信 钟华斌 唐文武 
新冠病毒Omicron变异株是2021年11月首次在南非发现,并已成为当前传染性最高的主流变异株,其传染性和S蛋白位点变异存在相关性。本文通过生物信息学方法对Omicron变异株的S蛋白变异位点进行分析,并与多种冠状病毒S蛋白进行多序列比对及...
关键词：S蛋白 变异位点 病毒感染性 冠状病毒 多序列比对 位点变异 序列保守性 靶向药物 
中华按蚊OCT家族基因的多样性及序列特征
《昆虫学报》2021年第3期337-347,共11页雷丹 闫振天 张肖肖 陈斌 
国家自然科学基金项目(31872262,31672363);国家科技基础性工作专项重点项目(2015FY210300)。
【目的】在全基因组水平鉴定、分类和命名中华按蚊Anopheles sinensis有机阳离子转运体(organic cation transporter,OCT)家族基因,为昆虫OCT基因提供信息框架。【方法】从NCBI,VectorBase和EMBL数据库下载冈比亚按蚊An.gambiae、黑腹果...
关键词：中华按蚊 有机阳离子转运体家族 全基因组鉴定 序列保守性 系统发育 
鲤CC型趋化因子CCL-C5a样基因的克隆、组织表达与进化分析被引量：1
《农业生物技术学报》2012年第4期426-435,共10页汪金兔 李炯棠 万玉美 冀培丰 崔润滋 张研 蒋丽 徐鹏 孙效文 
国家高技术研究发展计划(863)项目(No.2011AA100401);公益性行业(农业)科研专项项目(No.200903045);中国水产科学研究院本级基本科研业务费(No.2011C016)
趋化因子家族是一类能诱导白细胞激活和迁移的趋化性细胞因子家族,是鱼类先天免疫的重要组成部分。CC类家族是趋化因子家族中最大的家族之一。为研究鲤CC类家族成员的组织表达和进化模式,以及进一步研究鲤CC类趋化因子的免疫调控机制,...
关键词：鲤 免疫反应 CC趋化因子 克隆 脂多糖 序列保守性 
大豆二核苷酸SSR侧翼序列保守性分析被引量：4
《大豆科学》2010年第2期195-198,共4页詹少华 盛新颖 樊洪泓 蔡永萍 林毅 
安徽高校省级自然科学研究重点资助项目(KJ2008A089)
从NCBI下载了大豆的EST和GSS序列,以SSR两侧序列各100 nt的片段作为分析材料,统计SSR数目、计算侧翼序列碱基组成,对SSR侧翼序列进行了序列比对和数据库blast搜索。结果表明:大豆SSR分布频率为1/6.67kb,侧翼序列GC含量为37.83%,二核苷...
关键词：SSR引物 序列保守性 二核苷酸 大豆 侧翼序列 blast 多类型 NCBI 
miRNAs在不同物种进化中序列保守性的研究被引量：3
《辽宁师范大学学报（自然科学版）》2009年第3期351-355,共5页王莹 宋响文 
miRNAs在不同物种的进化中存在保守性,不仅单独在动物或是植物中存在保守性,而且在动植物之间也同样存在.本研究在人和动物的不同组织中克隆到了同源性很高的序列,将所得结果与已发表的成熟的miRNAs比对,发现克隆到的序列与植物中miRNA...
关键词：MIRNAS 克隆 miRNA319 保守性 
人和鸡溶菌酶结构保守性的对比研究被引量：2
《辽宁大学学报（自然科学版）》2009年第2期97-100,共4页宋有涛 于媛媛 李欣 李辉 张惠丽 
国家自然科学基金资助(30600113);辽宁省教育厅项目(20085100);沈阳市科技局项目(1063305-1-00)部分资助
人体内的溶菌酶在第56位、第67位残基发生自发突变的情况下可以通过分子间的聚集形成淀粉样病变,产生一系列的临床症状甚至导致死亡.本研究基于STAMP结构比对算法,使用VMD软件主要从结构角度比较了人、鸡、狗、鼠四种脊椎动物溶菌酶的...
关键词：溶菌酶 淀粉状聚集 序列保守性 结构保守性 系统发生树 
生物工程
《中国学术期刊文摘》2008年第19期168-169,共2页
大肠杆菌MalQ基因的克隆与原核融合表达,聚乳酸／丝素蛋白复合组织工程支架的制备及生物学性能的评价,谷胱甘肽合成酶的克隆与工程菌筛选,二氧化碳对酿酒酵母生长代谢的抑制,球形β-TCP生物陶瓷的生物学性能观察,基于序列保守性和蛋白...
关键词：生物工程 蛋白质相互作用 谷胱甘肽合成酶 生物学性能 组织工程支架 酿酒酵母 Β-TCP 序列保守性 
基于序列保守性和蛋白质相互作用的真核蛋白质亚细胞定位预测被引量：8
《生物化学与生物物理进展》2008年第5期531-535,共5页张松 夏学峰 沈金城 孙之荣 
国家重点基础研究发展计划(973)(2003CB715900);国家高技术研究发展计划(863)(2006AA020403);国家自然科学基金(30770498)资助项目~~
蛋白质的亚细胞定位是进行蛋白质功能研究的重要信息.蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,有效地发挥功能.尝试了将保守序列及蛋白质相互作用数据的编码信息结合传统的氨基酸组成编码...
关键词：亚细胞定位 氨基酸组成 序列保守性 蛋白质相互作用 支持向量机 
类胡萝卜素代谢途径中相关番茄红素环化酶的功能被引量：12
《中国食品添加剂》2005年第5期40-43,共4页朱跃辉 姜建国 
国家自然科学基金资助项目(20076020)
番茄红素环化是其生物合成途径中的一个关键分支点。自然界存在两类氨基酸序列不相关的番茄红素环化酶,其中单体型环化酶在成环的化学机理,底物特异性和活性,蛋白特征及氨基酸序列保守性等方面的存在相似性,包括G-细菌的番茄红素环化酶C...
关键词：番茄红素环化酶 环化机理 底物特异性 序列保守性 
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