系统发生树

作品数:169被引量:696H指数:13
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相关作者:俞永新董关木刘爱红关贵全罗建勋更多>>
相关机构:山东大学浙江大学中国农业科学院兰州兽医研究所扬州大学更多>>
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安徽省硬蜱科一新纪录种的鉴定
《中国国境卫生检疫杂志》2023年第5期419-423,496,共6页章乐生 汪敏 汪峰峰 马晓荷 李清越 王旗 
安徽省卫生健康委科研项目(AHWJ2021b025)。
目的 对安徽省蜱类种群分布调查中发现的一新纪录种进行鉴定。方法 对2022年安徽省合肥市蜱类分布调查中采集的蜱标本进行形态学鉴定后,采用PCR方法扩增蜱线粒体16S rRNA基因和细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因,测序后进行同源性分析,用Me...
关键词:褐黄血蜱 新纪录种 安徽 系统发生树 
国内外36个群体30个常染色体InDel位点的荟萃分析和系统树
《中国优生与遗传杂志》2023年第6期1114-1118,共5页王亚丽 陈丽琴 王嘉栎 熊磊 孔倩倩 贺世悦 白慧茹 顾捷 宋振祥 
2019年内蒙古自治区自然科学基金项目(2019MS08155);2019年内蒙古医科大学实验室开放基金项目(2019KF04);内蒙古医科大学大学生科技创新“英才培育”(YCPY2022073);内蒙古医科大学大学生创新创业训练计划项目(202210132063)。
目的为了研究国内外不同地区36个群体30个常染色体InDel位点的遗传关系。方法收集国内外不同地区的36个群体30个常染色体InDel位点的基因频率,通过统计其遗传距离,构建系统发生树,并进行多维尺度分析。结果经统计遗传距离,发现华东畲族...
关键词:法医遗传学 插入缺失位点 系统发生树 遗传相关性 
20个STR基因座在湖南汉族人群中的遗传多态性
《中国司法鉴定》2023年第2期67-75,共9页廖怡 高伯笛 赵晓蒙 钟娟芳 张前军 杜娟 谭跃球 卢光琇 林戈 李汶 
目的对湖南汉族人群20个常染色体短串联重复序列(short tandem repeat,STR)基因座的等位基因分布、群体遗传学参数和邻近群体的遗传分析进行研究,评估其在法医学中的应用价值。方法应用Power-Plex21^(■) 试剂盒对2997例湖南汉族无关个...
关键词:法医遗传学 遗传多态性 短串联重复序列 系统发生树 湖南汉族 
基于分子数据的系统发生树构建被引量:5
《植物学报》2023年第2期261-273,共13页彭焕文 王伟 
中国科学院战略性科技先导专项(B类)(No.XDB31030000);国家自然科学基金(No.32170210,No.32011530072,No.31770233,No.31770231)。
系统发生学是研究生物类群间进化关系的学科。随着测序技术、分析方法和计算能力的改进,分子数据被广泛应用,促进了系统发生学的快速发展。系统发生树已成为生态学和比较生物学等研究领域的有力工具。然而,许多研究在进行系统发生树构...
关键词:系统发生树构建 分子系统学 联合分析 核苷酸替换模型 
基于RAD-seq的西番莲系统进化分析及种间SSR标记开发被引量:4
《农业生物技术学报》2022年第11期2108-2118,共11页田青兰 刘洁云 黄伟华 夏秀忠 杨行海 覃柳燕 张英俊 牟海飞 吴艳艳 
国家自然科学基金(32060660);广西科技重大专项(桂科AA22068091-1);广西自然科学基金(2021GXNSFBA075044;2019GXNSFAA245002;2018GXNSFBA281024);广西农业科学院优势学科团队项目(桂农科2021YT089);广西农业科学院科技发展基金(桂农科2022JM53);广西浦北百香果试验站项目(桂TS2022010)。
西番莲(Passiflora spp.)是中国南方重要的果树,其种间进化关系尚不清楚,且缺乏通用性分子标记。本研究基于酶切位点相关DNA测序(restriction site-associated DNA sequencing,RAD-seq)技术对西番莲属6个种共10份种质的系统进化、SSR位...
关键词:西番莲 SNP 系统发生树 SSR 通用性 
61株水源性铜绿假单胞菌耐药分析及其16S rRNA系统发育学研究被引量:4
《食品安全质量检测学报》2022年第13期4150-4156,共7页张娟 綦艳 周臣清 赵玲 黄宝莹 杨纯佳 佘之蕴 
广州市科技计划项目(201804010244、201904010102);广东省食品生物危害因素监测工程技术研究中心(2019A072);广东省质量技术监督局科技项目(2022CZ03)~。
目的 了解铜绿假单胞菌的分子多样性和耐药性,采用16SrRNA基因序列分析法对2018—2020年间分离自广东地区桶装水中的61株铜绿假单胞菌进行同源性分析,并探讨其对11种不同抗生素的耐药性。方法 采用27F/1492R通用引物对目标菌的16SrRNA...
关键词:铜绿假单胞菌 16S rRNA 系统发生树 抗生素耐药 
四川盆地6个地方鸡群体遗传关系研究被引量:4
《畜牧兽医学报》2022年第2期370-380,共11页尤桂爽 易兴友 蒋美山 李中伟 谭和林 曹池 舒刚 田尧夫 朱庆 赵小玲 
重庆市开州区农业农村委员会专项资金;2020年泸州市院士专家工作站第五批建站企业资金资助。
随着交通便利与市场化杂交利用,我国地方鸡遗传资源面临血液混杂、品种来源和品种间的遗传关系不清晰的问题。为了给第三次全国畜禽遗传资源普查工作提供依据。本研究对位于中国大巴山脉和乌蒙山区的6个地方鸡群体(每个群体公、母各10只...
关键词:地方鸡品种 遗传多样性 简化基因组 基因流 系统发生树 
一株兼性厌氧反硝化细菌的分离与鉴定
《微生物前沿》2021年第3期152-160,共9页余安祺 张博 
本项目从水产养殖的实际需求出发,尝试对具有水质净化作用的硝化细菌及其群落中其它菌种进行分离和鉴定。本实验中利用硝化细菌可氧化铵根获得能量的营养特性,采用四种简单的无机盐(包括NH₄Cl、NaHCO₃、Na₂HPO₄、NaCl)及琼脂糖配置了分...
关键词:反硝化细菌 硝化细菌 选择培养基 系统发生树构建 
云南回族人群17个常染色体STR基因座的遗传多态性被引量:4
《法医学杂志》2021年第4期574-577,共4页张幼芳 张巍 侯思如 
STR是当前法医DNA分析的主流遗传标记,具有较高的突变率,这虽然会影响法医分型判断和鉴定意见的准确性,但为群体遗传学提供了研究基础。因此,常染色体STR基因座被广泛运用于人类群体遗传学研究。本研究对云南回族人群17个常染色体STR基...
关键词:法医遗传学 多态现象 遗传 短串联重复 遗传距离 系统发生树 回族 云南 
合肥地区2017—2018年麻疹病毒基因型特征分析
《安徽预防医学杂志》2021年第3期192-195,共4页王海 张文艳 黄颖 
安徽省教育厅质量工程项目(2020jyxm0914)。
目的了解2017—2018年合肥地区麻疹病毒流行株的基因型别特征,为麻疹防控提供依据。方法采集2017—2018年间麻疹病例的咽拭子标本,抽提RNA,采用RT-PCR方法扩增麻疹病毒核蛋白(N)基因的羧基端450个核苷酸,测序结果在Genbank上进行Blast...
关键词:麻疹病毒 基因型 系统发生树 
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