基于高通量测序分析头颈肿瘤中CircRNAs的表达谱差异  

CircRNAs expression profile differences in head and neck tumors based on high-throughput sequencing

作　　者：王榴倩 沈志森[2] 顾姗姗 邓红霞[2] 李赞[3] WANG Liuqian;SHEN Zhisen;GU Shanshan

机构地区：[1]宁波大学医学院,宁波315040 [2]宁波大学附属李惠利医院 [3]湖南省肿瘤医院

出　　处：《现代实用医学》2021年第5期576-578,共3页Modern Practical Medicine

基　　金：浙江省自然科学基金(LY19H160014、LQ21H130001);宁波市医疗卫生品牌学科建设项目(PPXK2018-02);浙江省医药卫生科技计划项目(2021KY307)。

摘　　要：目的基于高通量测序分析头颈肿瘤(HNC)中环状RNA(CircRNAs)的表达谱差异探究其临床应用价值。方法通过高通量测序、基因本体和KEGG通路分析检测18例HNC患者的肿瘤组织及癌旁组织中CircRNAs的表达及其功能。采用实时荧光定量PCR验证部分CircRNAs在137例HNC组织及癌旁组织中的差异表达,结合临床资料和ROC曲线分析其应用价值。结果在18例HNC肿瘤组织和癌旁组织中共有714个CircRNAs差异表达,涉及的主要功能和通路与肿瘤相关。hsa_circ_0012212和hsa_circ_0016148在137例HNC组织的表达水平均低于癌旁组织(均P<0.05)。结合临床资料分析发现hsa_circ_0012212与年龄相关,hsa_circ_0016148与头颈肿瘤分类和淋巴结转移相关(均P<0.05)。ROC曲线分析表明hsa_circ_0012212和hsa_circ_0016148对HNC的诊断具有潜在价值。结论hsa_circ_0012212和hsa_circ_0016148有望成为HNC诊断的分子标志物。

关 键 词：头颈肿瘤 CircRNAs 高通量测序 基因 标志物 

分 类 号：R739.91[医药卫生—肿瘤]