基于免疫基因女性生殖系统原发性恶性淋巴瘤分型和免疫治疗敏感性分析  

作　　者：彭帅羚 

机构地区：[1]中国科学院大学附属肿瘤医院浙江省肿瘤医院,浙江杭州310022 [2]中国科学院肿瘤与基础医学研究所,浙江杭州310022

出　　处：《中国妇幼保健》2021年第13期2945-2948,共4页Maternal and Child Health Care of China

摘　　要：目的探索基于女性生殖系统原发性恶性淋巴瘤相关免疫基因的共识聚类分型和分型群组之间免疫治疗的敏感性。方法从人类基因图谱(TCGA)数据库和基因表达综合(GEO)数据库(GSE138734,GSE168422)下载恶性淋巴瘤数据全转录组测序数据RNA-seq,提取其中原发部位为女性生殖系统的数据集合,进行批次矫正和对数值转换。从IMMPORT数据库提取免疫基因相关信息。使用R软件和edge R包进行差异基因分析。以差异倍数(FC)大于4,即|log_(2)FC|>2,P<0.05为筛选标准。使用单因素COX分析筛选与预后相关的免疫基因。采用Ward’s方法对所有样本进行垂直分层聚类分析。单因素和多因素COX分析探索患者预后相关的独立因素。根据垂直分层聚类分析的结果,结合样本全转录组数据,进行主成分分析(PCA)。比较不同聚类患者PD-L1表达的差异性。结果共筛选出正常组织与女性生殖系统原发性恶性淋巴瘤组织差异表达的免疫相关基因102个,其中在淋巴瘤组织中上调的55个;在淋巴瘤组织中下调的47个。单因素COX分析表明共20个免疫基因与患者预后相关(P<0.05),其中16个基因表达量越高预后越差(HR> 1);4个基因表达量越高预后越好(HR<1)。共识聚类分型将176例患者分为群组1 (113例)和群组2 (63例)。PCA分析表明,群组1和群组2组间具有良好的区分度,基于差异表达免疫相关基因的聚类分型,可以表明样本特征。单因素COX分析表明,聚类分型群组与女性生殖系统恶性淋巴瘤患者预后相关,群组1的预后较群组2好(P<0.05,HR>1);多因素COX分析表明,年龄和聚类分型群组是女性生殖系统恶性淋巴瘤患者预后相关的独立危险因素(P<0.05,HR>1)。免疫治疗靶点敏感性分析表明PD-L1在群组1中的表达量(11.31±5.14)显著高于其在群组2中的表达量(3.76±1.41),差异有统计学意义(t=19.487,P<0.05),群组1接受PD-L1靶点的免疫治疗较群组2敏感。结论�

关 键 词：女性生殖系统 原发性恶性淋巴瘤 免疫基因 分型 

分 类 号：R737.3[医药卫生—肿瘤]