基于生物信息学的酒精性肝炎特异性致病基因及其靶向中药活性成分筛选研究  

作　　者：杨焘 曾梅艳 宋厚盼[1,3] 陈新怡 陈小娟 朱晓彤 刘涛 冯瑶[1,2] 刘恒铭 

机构地区：[1]湖南中医药大学中医诊断学重点实验室,湖南长沙410208 [2]湖南中医药大学医学院,湖南长沙410208 [3]湖南中医药大学中医学院,湖南长沙410208

出　　处：《时珍国医国药》2021年第7期1763-1767,共5页Lishizhen Medicine and Materia Medica Research

基　　金：国家自然科学基金(81703920);湖南省自然科学基金(2019JJ50442);湖南省大学生研究性学习和创新性实验计划项目(S202010541040);湖南中医药大学校级科研基金项目(2018XJJJ28;2020XJJJ012)。

摘　　要：目的运用生物信息学方法探讨酒精性肝炎(AH)发病的核心基因及其可能的靶向中药活性成分,为AH的临床治疗提供理论依据。方法利用GEO数据库下载与AH发病相关的基因芯片数据,筛选出正常人与AH患者的差异表达基因;利用DAVID对AH患者与正常人特异性差异表达基因进行GO和KEGG分析;运用STRING数据库构建AH患者与正常人特异性差异表达基因蛋白质-蛋白质交互作用(PPI)网络;利用Cytohubba筛选AH发病的核心基因;通过比较毒物基因组学数据库筛选可能用于治疗AH的中药活性成分。结果得到AH患者与正常人特异性差异表达基因631个,其中上调基因300个(47.54%)、下调基因331个(52.46%)。这些基因主要涉及细胞黏附、细胞外基质组织、对药物的反应等生物过程,主要位于细胞外泌体、细胞外基质、细胞外空间等,分子功能主要包括肝素结合、结合细胞外基质、钙离子结合等。这些特异性差异表达基因主要与PI3K-Akt信号通路、AMPK信号通路、p53信号通路等密切相关。进一步研究获得CXCL8、ESR1、FOS等10个与AH发病密切相关的核心基因。基于核心基因检索到白藜芦醇、槲皮素、辣椒素、姜黄素、大黄素等50个可能用于治疗AH的中药活性成分。结论从生物信息学角度探讨了AH的发病机制及其可能涉及的核心基因,并筛选出可能用于治疗AH的中药活性成分,可为AH的基础实验及临床研究提供一定的科学依据。

关 键 词：酒精性肝炎 生物信息学 靶向治疗 基因 中药 

分 类 号：R575.1[医药卫生—消化系统] R2-03[医药卫生—内科学]