检索规则说明:AND代表“并且”;OR代表“或者”;NOT代表“不包含”;(注意必须大写,运算符两边需空一格)
检 索 范 例 :范例一: (K=图书馆学 OR K=情报学) AND A=范并思 范例二:J=计算机应用与软件 AND (U=C++ OR U=Basic) NOT M=Visual
机构地区:[1]宁波市第一医院,宁波315010
出 处:《现代实用医学》2021年第10期1295-1297,F0003,F0004,共5页Modern Practical Medicine
基 金:宁波市自然科学基金项目(2017A610209);浙江省医药一般项目(2020KY822)。
摘 要:目的利用生物信息学技术探究动脉粥样硬化斑块破裂的关键基因。方法对GEO数据库中的基因芯片进行检索筛选,获取GSE41571和GSE120521表达芯片,采用生物信息学工具和方法对芯片进行差异基因表达分析及功能分析。结果获得96个差异表达基因,其中表达上调基因17个,表达下调基因79个。GO和KEGG分析发现,表达下调的差异基因功能主要富集在细胞黏附、细胞基质黏附、钙离子结合和钾离子跨膜转运等,通路主要富集在调节干细胞多能性的信号通路;上调的基因功能富集于免疫反应、血管内皮生长因子受体信号通路、细胞周期蛋白依赖性蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性及蛋白质结合等。GSE41571芯片得到FZD7、ASPN、PAK3、STK38L、KIF3A、COL21A1、FAP、LCP2、HECW2、GLIS2,除LCP2上调外,其余基因在破溃斑块中均表达下调。GSE120521芯片中基因表达情况与GSE41571芯片结果一致。结论LCP2可能为预测动脉粥样硬化斑块破裂和治疗提供新的分子靶点。
分 类 号:R543.5[医药卫生—心血管疾病]
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