利用SLAF-seq简化基因组测序技术对驴基因组进行测序分析  

作　　者：肖海霞[1] 阿布来提·苏来曼 托乎提·阿及德[1] 努尔尼萨·莫拉尼亚孜 帕热哈提江·吾甫尔 王琼[1] 张国庭[1] 谢立荣 苏玲玲[1] 买买提·克玉木[1] 田可川[1] 刘武军[2] 

机构地区：[1]新疆畜牧科学院畜牧研究所,新疆乌鲁木齐830011 [2]新疆农业大学,新疆乌鲁木齐830052

出　　处：《畜牧业环境》2021年第21期27-28,共2页Animal industry and environment

基　　金：自治区公益性科研院所基本科研业务经费-(kygy2016015);自治区重点研发计划项目(2020B01002,2020B01002-1);自治区自然基金(2021D01A58)。

摘　　要：本文利用SLAF-seq简化基因组测序技术,通过选择驴基因组预测电子酶切组合方式,最终使用RsaI+EcoRV-HF?进行酶切,酶切效率为95.24%,将长度为364~394bp的测序序列定义为一个SLAF标签,预测了到234762个SLAF标签。通过生物信息学分析获得SLAF标签数为1,416,014个SLAF标签数(900,598个多态性SLAF标签),获得的群体SNP为4,887,196个,为与疆岳驴乳用性状做全基因组关联分析奠定了基础。

关 键 词：疆岳驴 SLAF-seq 测序分析 

分 类 号：TP3[自动化与计算机技术—计算机科学与技术]