测序分析

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转录组测序分析冷水游泳运动调节大鼠机体炎症反应的机制
《中国组织工程研究》2025年第29期6205-6211,共7页司俊成 彭丽娜 孙莉莉 王宇 石磊 沈雯慧 李孟琪 臧万里 
哈尔滨体育学院实验室平台专项(LAB2021-07);项目负责人:彭丽娜。
背景:冷环境中运动,机体炎症反应受冷应激及运动应激双因素作用,其作用机制仍有待探究。目的:基于转录组测序技术探究冷水游泳对大鼠机体炎症反应的影响及机制。方法:40只雄性SD大鼠随机分为室温对照组、室温游泳组、冷水对照组、冷水...
关键词:冷水游泳 炎症反应 转录组 NOD样受体信号通路 差异表达基因 工程化组织构建 
转录组测序分析黄连总碱抗脑缺血的作用机制
《中国组织工程研究》2025年第19期4161-4171,共11页田良良 周瑞 曹光昭 张晶晶 
国家自然科学基金面上项目(81974550),项目负责人:张晶晶;中国中医科学院创新工程(CI2021A04612),项目负责人:张晶晶。
背景:黄连清热燥湿、泻火解毒,黄连及其成分对脑缺血有显著的保护作用,基于网络药理学和转录组测序探究黄连总碱抗脑缺血的作用机制。目的:在明确黄连总碱对脑缺血大鼠保护作用的基础上,基于网络药理学和转录组测序技术探讨黄连总碱干...
关键词:黄连总碱 脑缺血 转录组测序 过氧化物合酶2 脑源性神经营养因子 瞬间受体电位A1 
基于转录组测序分析芹菜素抑制巨噬细胞焦亡的潜在作用机制
《现代医药卫生》2025年第4期828-835,共8页白勒谢 吴帅凯 叶利经 潘玉芝 吴丹媚 赵国军 
国家自然科学基金项目(81870337);广东省自然科学基金面上项目(2024A1515012850)。
目的探讨芹菜素对巨噬细胞焦亡的影响及机制。方法体外培养THP-1细胞,应用佛波酯将其诱导分化为巨噬细胞,以脂多糖(LPS)和尼日利亚菌素联合刺激诱导巨噬细胞焦亡。通过光学显微镜观察细胞形态,采用Western blot检测Gasdermin D-N(GSDMD...
关键词:巨噬细胞 细胞焦亡 芹菜素 转录组测序 核糖体生物合成信号通路 
基于转录组和单细胞测序数据分析CALU与肝细胞癌患者预后的关系及其作用机制
《吉林大学学报(医学版)》2025年第2期447-459,共13页王小燕 李雪莲 梁斌 田文斐 马海林 莫之婧 
国家自然科学基金项目(32360171);广西壮族自治区科技厅自然科学基金项目联合专项项目(桂林医学院专项)(2025GXNSFHA069010);广西壮族自治区科技厅自然科学基金项目(2024GXNSFAA010362)。
目的:通过生物信息学方法分析人钙腔蛋白(CALU)的表达水平与肝细胞癌(HCC)预后之间的关系,构建HCC预后列线图,并阐明其可能的作用机制。方法:从癌症基因组数据库(TCGA)下载374例HCC组织样本数据,从基因型组织表达数据库(GTEx)下载160例...
关键词:人钙腔蛋白 肝细胞癌 生物信息学 单细胞测序分析 癌症预后 
先天性巨痣自发消退患者的单细胞测序分析
《组织工程与重建外科》2025年第2期162-171,共10页金佳敏 赖柏翰 顾婕妤 魏伯轩 谢峰 
上海市科学技术委员会临床医学研究中心项目(22MC1940300)。
目的探究先天性巨痣(GCMN)自发消退背后的细胞群更替和生物学行为。方法对先天性巨痣患者的正常组织、巨痣的颜色消退组织和未消退组织进行10×单细胞测序。先量化原始数据的基因表达,再依次对数据进行降维、聚类、分群和可视化,根据差...
关键词:先天性巨痣 单细胞测序 肿瘤微环境 
高通量测序分析幽门螺杆菌阳性慢性胃炎患者胃黏膜真菌及细菌菌群
《胃肠病学和肝病学杂志》2025年第4期504-511,516,共9页刘思然 孟宪梅 年媛媛 王璐 
内蒙古自治区科技计划项目(2021GG0232)。
目的探究幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)感染对不同程度慢性胃炎患者胃内真菌及细菌丰度及多样性的影响。方法收集我院H.pylori阳性患者的胃黏膜标本作为试验组,分为:H.pylori阳性慢性非萎缩性胃炎(non-atrophic gastritis,C...
关键词:幽门螺杆菌 慢性胃炎 高通量测序 真菌 细菌 
王不留行药用植物麦蓝菜叶片转录组测序分析
《中兽医医药杂志》2025年第2期1-7,共7页张超强 尉明杰 张家银 杨彬 任培荣 景小强 张勇 王恩军 
甘肃省自然科学基金(22JR11RG225);河西学院博士科研启动金(KYQD2022013);甘肃省科技计划项目(23CXNG0006);张掖市科技计划项目(ZY2022KY01);河西学院校长基金创新团队项目(CXTD2022011);大学生创新创业训练计划项目(202210740073,S202410740028)。
为获得王不留行的部分转录组信息特征,本研究基于Illumina 6000平台,对麦蓝菜叶片进行高通量测序,并组装了所有的转录本,原始数据上传NCBI数据库,登录号:PRJNA1149650。去冗余后得到99766条unigenes,在七大数据库中获得功能注释65079条...
关键词:王不留行 麦蓝菜 转录组 UNIGENE 转录因子 SSR标记 
短促生乳杆菌细菌素生物学特性研究及其全基因组测序分析
《中国饲料》2025年第7期38-43,共6页孙思佳 潘小瑞 马明瑞 赵新凌 李国江 董文龙 
吉林省自然科学基金(YDZJ202301ZYTS349)。
为筛选出对猪萎缩性鼻炎多杀性巴氏杆菌具有良好抑制效果的细菌素,本研究从橙子皮中分离鉴定出一株短促生乳杆菌,命名为SSJ-1,该菌株所产细菌素对猪萎缩性鼻炎多杀性巴氏杆菌具有良好抑制效果。SSJ-1于4 h开始进入对数生长期,在30 h处...
关键词:多杀性巴氏杆菌 短促生乳杆菌 细菌素 全基因组测序 
1株多重耐药鸡源印第安纳沙门菌特性与全基因组测序分析
《畜牧与兽医》2025年第4期60-70,共11页沈学怀 赵瑞宏 尹磊 侯宏艳 戴银 胡晓苗 殷冬冬 王洁茹 潘孝成 周学利 刘永杰 
安徽省重点研究与开发计划项目(202204c06020039);国家蛋鸡产业技术体系项目(CARS-40);安徽省农业科学院平台项目(2024YL016);安徽省家禽产业技术体系项目(AHCYJSTX-06)。
鸡源沙门菌不仅会引起鸡的感染发病,还会威胁食品和公共卫生安全。本研究从安徽肥东地区1只疑似沙门菌感染病鸡组织中分离出1株沙门菌,命名为SM24,评价该菌株的生长曲线,测定菌株致病性和半数致死量(LD50),用Kirby-Bauer法对分离株进行...
关键词:鸡源印第安纳沙门菌 致病性 耐药性 毒力基因 耐药基因 全基因组测序 
基于空间转录组和单细胞测序分析线粒体自噬相关基因在结肠癌中的作用
《实用临床医药杂志》2025年第7期92-99,共8页束长新 韦晨 汤东 
江苏省重点研发计划(社会发展)项目(BE2022773)。
目的运用机器学习算法分析单细胞测序数据和空间转录组数据,探讨线粒体自噬相关基因在结肠癌中的作用。方法采用支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)和随机森林算法筛选关键的线粒体自噬相关基因,结合单细胞测序数据和空间转录组数据,对细...
关键词:结肠癌 单细胞测序 空间转录组 线粒体自噬 机器学习算法 肿瘤微环境 RPS5基因 成纤维细胞 
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