UNIGENE

作品数:47被引量:204H指数:8
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相关作者:蔡时可王继华张文广吕晓曼黄敏更多>>
相关机构:浙江大学山东农业大学广东海洋大学内蒙古农业大学更多>>
相关期刊:《黄冈师范学院学报》《中国农业科学》《中草药》《Journal of Integrative Agriculture》更多>>
相关基金:国家自然科学基金国家科技支撑计划国家现代农业产业技术体系建设项目中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
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葫芦巴转录组测序及生物信息学分析
《分子植物育种》2024年第13期4254-4261,共8页王星哲 陈阳 武悦 单飞彪 杜瑞霞 闫文芝 刘春晖 
内蒙古自治区科技成果转化专项(BZC191033);内蒙古农牧业科学院青年创新基金项目(2020QNJJNO15)共同资助。
本研究基于RNA-Seq技术对葫芦巴幼苗叶片进行转录组测序及生物信息学分析。获得葫芦巴转录组数据,为后续研究葫芦巴基因功能、代谢途径、分子标记及调控机理等方面提供参考。对测序数据拼接组装后获得16 456条unigene,总长度为19 770 39...
关键词:葫芦巴 转录组 UNIGENE 分子标记 
基于转录组分析金属离子对绿绒蒿属3种植物花瓣呈色的影响被引量:1
《植物资源与环境学报》2023年第5期16-27,共12页罗军 陈丽琦 李拓键 区智 屈燕 
国家自然科学基金项目(32160404,31460218);云南省万人计划青年拔尖人才项目(YNWR-QNBJ-2019-211)。
为探究金属离子对绿绒蒿属(Meconopsis Vig.)3种植物花瓣呈色的影响,测定了盛开期全缘叶绿绒蒿(M.integrifolia(Maxim.)Franch.)、红花绿绒蒿(M.punicea Maxim.)和川滇绿绒蒿(M.wilsonii Grey-Wilson)花瓣中7种金属离子(包括Fe^(3+)、Mg...
关键词:绿绒蒿属 花色 金属离子 差异unigene 基因表达 
甜菊自交不亲和及自交亲和无性系自花授粉柱头的荧光显微观察和转录组分析被引量:2
《植物资源与环境学报》2023年第4期25-32,共8页杨永恒 张永侠 张婷 徐晓洋 孙玉明 王小敏 佟海英 原海燕 
江苏省自然科学基金项目(BK20201243);江苏省公益类科研院所自主科研项目(JSPKLB202057)。
为了探究甜菊(Stevia rebaudiana Bertoni)自交不亲和的生理和分子机制,以甜菊自交不亲和无性系‘B4’及自交亲和无性系‘Z8-42’为研究对象,对2个无性系的自花授粉柱头进行荧光显微观察和转录组分析。荧光显微观察结果显示:‘B4’自花...
关键词:甜菊 自交不亲和 柱头 差异表达unigene 荧光显微观察 转录组分析 
显齿蛇葡萄转录组测序、注释与分析被引量:1
《农业研究与应用》2022年第5期15-23,共9页徐友阳 王德勤 李静宇 梅瑜 王继华 蔡时可 
汕尾市省科技专项资金项目(220126225850658);广州市科技计划项目(20212210006);广东省农业科学院汕尾分院科技合作专项(2022)。
本研究通过高通量转录组测序和生物信息学分析获得显齿蛇葡萄的转录表达数据,提取显齿蛇葡萄叶片和茎的总RNA(Ribonucleic Acid,核糖核酸)、建库、测序、组装,注释和比对等生物信息分析技术得到显齿蛇葡萄转录组的遗传信息。共检测到23,...
关键词:显齿蛇葡萄 转录组 UNIGENE 功能注释 SSR 
中泰南五味子转录组测序及生物信息学分析被引量:3
《广州中医药大学学报》2022年第10期2387-2393,共7页李静宇 徐友阳 蔡时可 王继华 
广东省科技厅农业科技特派员项目(编号:KTP20210003);广东省农业科学院乡村振兴地方分院和专家工作站工作经费项目(2022)。
【目的】利用高通量测序技术获得中泰南五味子的转录组信息。【方法】中泰南五味子叶片总RNA经过提取、建库、测序、de novo组装,获得Unigene序列,再进行注释和比对,得到中泰南五味子转录组的遗传信息。【结果】共获得29915条Unigene,...
关键词:中泰南五味子 转录组 生物信息学 高通量测序 UNIGENE 功能注释 简单序列重复(SSR) 
鲫鱼血液、肝脏、卵巢组织转录组比较分析被引量:1
《江苏农业科学》2022年第3期28-35,48,共9页李青 何斌 陈群利 游萍 
贵州省科技计划(编号:黔科合基础[2018]1054、黔科合LH字[2017]7018号、毕科人才合字[2021]11号);贵州省教育厅创新群体重大研究项目(编号:黔教合KY字[2017]050)。
为进一步丰富鲫鱼基因组数据,对肝脏、血液和卵巢组织进行高通量转录组测序。采用Illumina Hiseq高通量测序平台进行转录组测序,对所获得序列进行比对、基因注释、差异表达和SNP、SSR分析。结果提示,组装得到127 801条unigene,平均长度...
关键词:鲫鱼 转录组学 肝脏 血液 卵巢 UNIGENE SNP分析 SSR分析 高通量测序 
扁茎黄芪转录组测序及生物信息学分析被引量:2
《华北农学报》2022年第1期42-49,共8页武悦 陈阳 王星哲 单飞彪 张勇 孙鸿举 
内蒙古科技重大专项(2019ZD009);内蒙古自治区应用技术研究与开发资金资助项目(5213322)。
为获得扁茎黄芪转录组信息及功能基因表达特征,以扁茎黄芪的幼苗叶片为材料,利用Illumina HiSeq平台进行转录组测序及生物信息学系统分析。结果显示,共获得扁茎黄芪Unigene 19280条,总长23472470 bp,其中GC含量达42.74%,测序质量和组装...
关键词:扁茎黄芪 转录组 生物信息学 UNIGENE 分子标记 
茅苍术二倍体和同源四倍体叶片转录组比较被引量:1
《植物资源与环境学报》2021年第4期41-49,共9页张子璇 谭明谱 王将 张成才 罗丽娜 向增旭 
财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系资助项目(CARS-21)。
采用转录组测序技术对茅苍术〔Atractylodes lancea(Thunb.)DC.〕二倍体和同源四倍体叶片进行无参转录组测序,并在前期研究基础上筛选叶片中的高可信度差异表达unigenes。结果显示:共获得495797个unigenes,GC含量为46.54%,平均长度为402...
关键词:茅苍术 二倍体 同源四倍体 差异表达unigene 功能注释 
云南火焰兰高通量转录组测序分析被引量:3
《分子植物育种》2021年第13期4293-4301,共9页辛雅萱 辛静 瞿绍宏 董章宏 姚国琼 杨琳懿 冯发玉 唐军荣 
云南省农业基础研究联合专项面上项目(2017FG001[-019])资助。
云南火焰兰(Renanthera imschootiana Rolfe)是濒临灭绝的附生植物,关于其分子水平的研究少有报道。为了获得云南火焰兰相关基因组基础信息,本研究通过Illumina HiSeqTM4000技术对云南火焰兰叶片进行转录组测序,并利用相关生物信息学数...
关键词:云南火焰兰 转录组 UNIGENE 
云南金花茶转录组序列分析及功能注释被引量:4
《经济林研究》2020年第3期85-94,共10页辛静 李斌 叶鹏 刘成 唐军荣 张贵良 辛培尧 
云南省林学一级学科建设项目;云南省林业厅国家公园试点建设项目(2136299)。
【目的】深入研究云南金花茶优良性状、基因功能和基因分布特征,可为云南金花茶乃至山茶属植物功能基因的探索以及该物种的遗传保护提供基础生物信息学理论参考。【方法】采用Illumina Hi Seq 2000技术,对云南金花茶叶片进行转录组测序...
关键词:云南金花茶 转录组 UNIGENE 功能 注释 
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