猎蝽科昆虫线粒体基因组的比较研究  

Comparative study on mitochondrial genomes in Reduviidae

作　　者：赵婉清 李巧 李莹 杨柳 郑茜之 张虎芳 Zhao Wanqing

机构地区：[1]忻州师范学院生物系,山西忻州034000

出　　处：《江苏农业科学》2022年第12期34-41,共8页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：山西省高等学校科技创新项目(编号:2019L09841);忻州师范学院院级科研基金(编号:2018KY04)。

摘　　要：线粒体基因组是系统发育常用的分子标记,本研究旨在对猎蝽科昆虫的线粒体基因组进行比较研究,着重分析基因重排、碱基组成、密码子使用偏好性等特征,并构建基于13个蛋白编码基因的系统发育关系。在GenBank数据库下载猎蝽科11亚科30属代表物种的线粒体基因组序列,通过Geneious 8.0.4抽提各编码基因的序列。利用MEGA 7.0统计碱基组成、氨基酸和核苷酸序列信息位点、起始密码子、终止密码子、相对密码子使用频率(RSCU)等序列基本信息。另外,利用DnaSP 6.0计算蛋白编码基因的非同义替换率(K_(a))和同义替换率(K_(s)),并通过K_(a)/K_(s)值比较基因的核苷酸进化速率。通过jModelTest选择进化模型,在MrBayes 3.2.2软件中构建基于贝叶斯法(BI)的系统发育树。结果表明:猎蝽科线粒体基因组均呈共线性结构,没有发现大面积的基因重排现象,只有部分序列中rrnS和trnT基因编码方向与原始序列编码方向相反,trnR和cytb基因出现多拷贝的现象。猎蝽科线粒体最常使用ATN起始密码子和TAA终止密码子。BI系统发育树对猎蝽科各亚科之间的关系进行了一定的解析,光猎蝽亚科(Ectrichodiinae)和猎蝽亚科(Reduviinae)为并系群,真猎蝽亚科(Harpactorinae)和锥猎蝽亚科(Triatominae)为单系群。本研究为猎蝽科昆虫的线粒体基因组进行了比较分析,为后续研究该科系统发生关系奠定了科学基础。

关 键 词：猎蝽科 线粒体基因组 比较基因组学 系统发育 分子标记 基因重排 碱基组成 密码子使用偏好性 

分 类 号：S433.3[农业科学—农业昆虫与害虫防治]