碱基组成

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淡紫灰链霉菌BP39基因组密码子使用偏好性分析
《微生物学杂志》2024年第6期78-84,共7页柯清林 上官宏斌 罗睿晗 崔立操 王飞 吴晓玉 
江西省重点研发计划重点项目(20171ACF60006);农业部功能食品重点实验室开放基金项目(201606)。
淡紫灰链霉菌(Streptomyces lavendulae)BP39是一株具有广谱杀菌性能的生防菌。为探讨菌株BP39基因组密码子的偏好性,本研究基于菌株BP39的6356条编码序列,利用CodonW软件,计算其GC含量、有效密码子数(ENC)和同义密码子相对使用频率(RS...
关键词：淡紫灰链霉菌 基因组 密码子偏好性 最优密码子 碱基组成 
不同物种肌生成素(MyoG)密码子使用模式分析被引量：10
《畜牧兽医杂志》2022年第6期10-18,共9页周刚 吴非凡 王礼伟 彭杰 谢鹏 秦进华 汪国莲 刘颖 
淮安市农业科学研究院科研发展基金(HNY202024);国家自然科学基金(31902127),生长环境中微生物丰富程度对仔猪免疫系统的调控机制研究;江苏省高校自然科学研究面上项目(19KJB230003)环境中微生物丰富程度对仔猪免疫系统的调控机制研究;2019年淮上英才计划项目资助。
肌生成素(MyoG)是最重要的肌生成调节因子(MRFs)之一,是控制骨骼肌生成的关键调控因子。密码子使用偏倚(codon usage bias, CUB)是目前基因组特有的一种特征,可以揭示物种间的特异性差异。此外,在基因序列密码子使用模型中,碱基组成的...
关键词：肌生成素 密码子使用偏倚 碱基组成动态 
水杉叶绿体基因组同义密码子使用偏好性被引量：3
《湖北民族大学学报（自然科学版）》2022年第2期121-128,共8页王茹 罗永坚 刘相泉 卢新雄 尹广鹍 邓志军 
国家自然科学基金项目(31860073);生物资源保护与利用湖北省重点实验室2020年度开放基金项目(PT012008).
水杉(Metasequoia glyptostroboides)是杉科水杉属唯一现存的孑遗种,也是我国一级保护的濒危特有树种,对其叶绿体基因组密码子使用偏好性及其主要影响因素进行分析,有利于水杉叶绿体基因组学研究、物种保护和种质创新.从在线数据库下载...
关键词：水杉 叶绿体基因组 同义密码子使用偏好性 碱基组成 自然选择 最优密码子 
猎蝽科昆虫线粒体基因组的比较研究被引量：3
《江苏农业科学》2022年第12期34-41,共8页赵婉清 李巧 李莹 杨柳 郑茜之 张虎芳 
山西省高等学校科技创新项目(编号:2019L09841);忻州师范学院院级科研基金(编号:2018KY04)。
线粒体基因组是系统发育常用的分子标记,本研究旨在对猎蝽科昆虫的线粒体基因组进行比较研究,着重分析基因重排、碱基组成、密码子使用偏好性等特征,并构建基于13个蛋白编码基因的系统发育关系。在GenBank数据库下载猎蝽科11亚科30属代...
关键词：猎蝽科 线粒体基因组 比较基因组学 系统发育 分子标记 基因重排 碱基组成 密码子使用偏好性 
口蹄疫浅述
《兽药市场指南》2021年第11期37-38,共2页冯佩平 张娣 
山东省生猪产业技术体系创新团队项目(SDAIT-08-20)。
口蹄疫(FMD)第一次被报道是在1514年的意大利牛上,1897年,科学家证明了一种可滤过的病毒引起了口蹄疫。从此开启了病毒学时代。一、口蹄疫病原随后的研究表明,FMD病毒由一个约8500个碱基组成的单链正链RNA基因组组成,被个结构蛋白包围。
关键词：口蹄疫 结构蛋白 RNA基因组 碱基组成 病毒学 
20种千屈菜科植物rbcL基因密码子使用偏好性分析被引量：6
《浙江农林大学学报》2021年第3期476-484,共9页郑钢 顾翠花 林琳 王杰 
浙江省自然科学基金资助项目(LY21C160001)。
【目的】分析千屈菜科Lythraceae植物rbcL基因密码子使用特性,明确密码子偏好性的影响因素,筛选rbcL基因异源表达和遗传转化的合适受体。【方法】从美国国家生物技术信息中心(NCBI)获取20种千屈菜科植物的rbcL基因全长编码区序列(CDS)数...
关键词：碱基组成 选择压力 突变压力 聚类分析 受体 
落叶松-杨栅锈菌基因组密码子使用偏好分析被引量：13
《菌物学报》2020年第2期289-297,共9页周显臻 曹支敏 于丹 
国家自然科学基金(31870630,31300544);陕西省自然科学基础研究计划(2018JM3043).
为了解落叶松-杨栅锈菌密码子使用模式,并探究影响其密码子偏好形成的因素,本研究利用CondonW对落叶松-杨栅锈菌标准菌株98AG31基因组中14650个基因进行分析,计算基因的有效密码子数,及64个密码子的相对使用度等偏好性参数。结果表明,...
关键词：落叶松-杨栅锈菌 密码子偏好 选择压力 突变压力 碱基组成 
生命“字母表”迎来4名新成员
《发明与创新（大科技）》2019年第3期7-7,共1页
地球生命的DNA包含4个碱基,现在,美国科学家将生命“字母表”的数量增加了一倍,首次合成出包含8个碱基的DNA。实验表明,合成DNA似乎能像天然DNA一样存储和转录信息。应用分子进化基金会创始人史蒂文·本纳领导的团队,通过调整普通碱基...
关键词：地球生命 字母 碱基组成 DNA 美国科学家 分子进化 胸腺嘧啶 分子结构 
基于碱基组成和分布的DNA序列特征提取方法及应用被引量：1
《燕山大学学报》2018年第1期59-66,74,共9页李玉双 魏东 吕艳芬 
河北省高等学校青年拔尖人才计划资助项目(BJ2014060);燕山大学"新锐工程"人才支持计划项目
通过特征提取方式挖掘生物信息数据中潜在的规律是生物信息学研究的基本问题之一。基于DNA序列的碱基转移概率、含量和位置比三类特征构造了24维特征向量,成功应用于11物种的β-珠蛋白基因完整编码序列和18哺乳动物线粒体基因组序列的...
关键词：转移概率 特征向量 系统发生树 必需基因 支持向量机 
几种植物花分生组织决定基因APETALA1密码子使用模式比较被引量：10
《园艺学报》2017年第3期504-514,共11页吴彦庆 李志远 赵大球 陶俊 
国家自然科学基金项目(31372097,31400592);江苏省高校自然科学研究重大项目(13KJA210005)
为了揭示花分生组织决定基因AP1(APETALA1)的分子机制以及物种间的进化关系,从GenBank数据库挑选8个不同植物AP1基因编码序列,利用R软件分别计算GC含量、有效密码子数(Effective number of codons,ENC)、同义密码子相对使用度(Relative ...
关键词：APETALA1 植物 密码子使用偏好性 碱基组成动力学 
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