TFF1在食管癌中表达及其基因调控网络  

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作  者:李亚光[1] 邓同兴[1] 宋德志[2] 李晓龙[2] 

机构地区:[1]漯河医学高等专科学校基础医学部,河南漯河462000 [2]广西医科大学基础医学院

出  处:《中国老年学杂志》2022年第14期3410-3415,共6页Chinese Journal of Gerontology

基  金:广西自然科学基金(2017GXNSFAA198063);漯河医学高等专科学校2019年创新创业发展能力提升工程项目(2019-LYZKYXM009)。

摘  要:目的探讨TFF1在食管癌中的表达及其潜在的基因调控网络。方法利用癌症基因组图谱数据库的测序数据和基因表达综合数据库,分析了TFF1在食管癌(ESCA)中的表达情况。使用Oncomine TM等分析工具进行表达分析,使用cBioPortal鉴定TFF1突变、突变相关生存曲线及相关功能网络。利用Linked Omics对TFF1基因表达差异进行了鉴定,并对基因本体论和基因与基因组通路使用京都百科全书进行了分析。结果TFF1在ESCA中过表达,且缺失是ESCA中最常见的TFF1突变类型,TFF1基因的突变也可能显著影响ESCA患者的预后。功能网络分析表明,TFF1可能通过参与NF-kappa B信号通路,Hippo信号通路等在ESCA中发挥作用。结论数据挖掘有效地揭示了TFF1在ESCA中的表达和潜在的调控网络,为进一步研究TFF1在肿瘤发生中的作用奠定了基础。

关 键 词:三叶因子1 食管癌 生物信息学 

分 类 号:R735.1[医药卫生—肿瘤]

 

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