基于生物信息学分析筛选卵巢癌预后相关的核心基因  

作　　者：黄蓓蓓 李洁[1,2] 孔昕 叶庆 

机构地区：[1]中国科学技术大学附属第一医院(安徽省立医院)临床病理中心,合肥230036 [2]中国科学技术大学智慧病理学研究所,合肥230036

出　　处：《临床与实验病理学杂志》2022年第10期1249-1252,共4页Chinese Journal of Clinical and Experimental Pathology

摘　　要：目的运用生物信息学方法筛选与卵巢癌预后相关的核心基因。方法对卵巢癌基因芯片数据集(GSE18520和GSE26712)进行差异分析,获得差异表达基因。应用Metascape在线数据库对差异基因的功能和通路进行富集分析,使用MCC算法筛选通路中的潜在核心基因并构建蛋白互作网络,采用Kaplan-Meier Plotter数据库进行生存期分析。结果差异分析显示,有540个基因在两个数据集中均存在差异表达。GO富集分析显示,差异基因在细胞外基质通路显著富集。基于蛋白互作网络和MCC算法获得10个在蛋白互作网络中发挥关键作用的核心基因,结合生存期分析筛选出5个与卵巢癌预后相关的基因。结论筛选出的COL4A1、LAMB1、LAMA4、VCAN和COMP可作为卵巢癌预后相关的分子标志物。

关 键 词：卵巢肿瘤 生物信息学 核心基因 预后 

分 类 号：R737.31[医药卫生—肿瘤]