子宫颈癌组织中环状RNA的表达谱及功能分析  

作　　者：郭依琳 王璐[1] 徐臻[1] 王武亮[1] 赵虎[1] 王倩[1] 

机构地区：[1]郑州大学第二附属医院妇产科,郑州450014

出　　处：《中华妇产科杂志》2022年第12期938-945,共8页Chinese Journal of Obstetrics and Gynecology

基　　金：河南省医学科技攻关计划联合共建项目(LHGJ20220476);河南省高等学校重点科研项目(23A320060);河南省重点研发与推广专项(科技攻关)项目(222102310651)。

摘　　要：目的探究子宫颈癌组织中环状RNA(circRNA)的表达谱,并对差异表达的circRNA进行功能分析。方法收集2021年2月至8月在郑州大学第二附属医院经病理检查确诊的15例子宫颈癌患者的癌组织及其癌旁组织标本。(1)采用circRNA高通量测序技术分析其中5例子宫颈癌患者的癌组织及其癌旁组织中circRNA的表达谱差异;对显著差异表达circRNA的亲本基因作基因本体(GO)功能注释及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。(2)将本研究中circRNA高通量测序并筛选出的差异表达circRNA与从美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因表达综合(GEO)数据库下载的基因表达谱GSE102686数据集中筛选出的差异表达circRNA取交集,选择差异倍数最高的3个显著下调和3个显著上调共6个circRNA,即hsa_circ_0079480、hsa_circ_0005480、hsa_circ_0003162和hsa_circ_0084927、hsa_circ_0002151、hsa_circ_0001849,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术验证15例子宫颈癌患者的癌组织及其癌旁组织中6个差异表达circRNA的表达。(3)选择6个差异表达circRNA中经过qRT-PCR技术验证的在子宫颈癌组织及其癌旁组织中表达水平有显著差异(P<0.05)的circRNA进行下一步的功能研究(共有3个差异表达circRNA,即hsa_circ_0005480、hsa_circ_0003162和hsa_circ_0084927),构建小分子干扰RNA(siRNA),转染子宫颈癌细胞系SiHa和HeLa细胞以敲低其表达,实验分为4组,即hsa_circ_0005480敲低组、hsa_circ_0003162敲低组、hsa_circ_0084927敲低组和阴性对照(NC)组,采用活细胞计数(CCK-8)法检测4组SiHa和HeLa细胞的增殖能力。(4)通过Starbase、CircInteractome等数据库预测能够与hsa_circ_0005480、hsa_circ_0003162和hsa_circ_0084927结合的微小RNA(miRNA),构建竞争性内源性RNA(ceRNA)网络,即circRNA-miRNA网络。结果(1)高通量测序结果显示,5例子宫颈癌患者的癌组织及其癌旁组织中共检测到26280个circRNA,有1421个差异表达的circRNA,其中表达�

关 键 词：铂类药物 HELA细胞 差异表达 基因表达谱 子宫颈癌 高通量测序 富集分析 功能分析 

分 类 号：R737.33[医药卫生—肿瘤]