利用RNA-seq技术筛选影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因  

作　　者：吴红芬 张颖[1] 侯冠彧[2] 王颖[1] 汪刘浩 吴科榜[1] 那威 

机构地区：[1]海南大学动物科技学院,海南海口570100 [2]中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南海口570100

出　　处：《中国畜牧杂志》2023年第1期182-187,共6页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：2019年海南省基础与应用基础研究计划高层次人才项目(2019RC101)。

摘　　要：本研究利用RNA-seq技术筛选影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因,旨在为低脂文昌鸡的分子育种提供理论依据。本研究结果显示,共有15 996个基因在文昌鸡腹部脂肪组织中表达,16 926个基因在儋州鸡腹部脂肪组织中表达,15 580个基因在文昌鸡和儋州鸡腹部脂肪组织中均有表达,95个基因在文昌鸡和儋州鸡腹部脂肪组织中差异表达。GO富集分析结果显示差异表达基因显著富集在细胞过程、分子活性物质运输等过程(P<0.05)。KEGG富集分析结果显示,差异表达基因在PPAR信号通路、TGF-β信号通路、不饱和脂肪酸的生物合成等途径富集。通过筛选与验证,最后确定SCD、SMOC1、IGFBP2、MSMB基因为影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因。

关 键 词：文昌鸡 腹脂沉积 RNA-SEQ 差异表达基因 候选基因 

分 类 号：S827.2[农业科学—畜牧学]