超声组织快速处理技术对小活检组织二代测序质控参数的影响  

作　　者：石晨曦[1] 李秀明 陈志[1] 黄山[1] 朱卫东[1] 郭凌川[1] 

机构地区：[1]苏州大学附属第一医院病理科,苏州215000

出　　处：《临床与实验病理学杂志》2023年第1期112-114,共3页Chinese Journal of Clinical and Experimental Pathology

摘　　要：目的探讨超声组织快速处理技术对小活检组织二代测序(next-generation sequencing,NGS)相关质控参数的影响。方法收集苏州大学附属第一医院2019年9月~2022年6月采用超声快速系统处理的26例小活检标本,其中肺癌8例,淋巴瘤15例,肠癌3例;另收集82例采用传统常规组织处理程序处理的小活检标本作为对照,其中肺癌11例,淋巴瘤68例,肠癌3例。HE切片肿瘤组织占比评估合格后提取DNA进行NGS检测,分析两者病理质控、抽提质控、建库质控、上机质控及数据分析质控等的一致性。结果与传统常规组织处理程序相比,使用超声快速处理技术处理的小活检标本DNA片段降解程度相对较高,预文库总量、平均测序深度、文库多样性、插入片段长度、覆盖均一性、序列回贴比率、碱基质量Q30占比等质控参数结果相近。结论超声组织快速处理技术能够高效地缩短组织处理时间,可应用于小活检组织NGS检测的前期处理。

关 键 词：超声组织快速处理技术 小活检组织 二代测序 质量控制 

分 类 号：R-331[医药卫生]