基于生物信息学分析HMG基因家族在肺腺癌中的表达和预后价值  

Expression and prognostic value of HMG gene family in lung adenocarcinoma based on bioinformatics analysis

作　　者：刘细帮 吴晓东[1] 徐瑛[1] 王学荣 阮烨飞 吴丹丹 LIU Xibang;WU Xiaodong;XU Ying

机构地区：[1]余姚市人民医院,浙江省余姚315400

出　　处：《现代实用医学》2023年第3期319-322,F0003,共5页Modern Practical Medicine

基　　金：余姚市科技计划重点项目(2022YZD01)。

摘　　要：目的探讨肺腺癌(LUAD)组织中高迁移率族蛋白(HMG)基因家族的表达,并分析其在LUAD患者中的预后价值。方法通过肿瘤基因图谱(TCGA)数据库获得HMG基因家族在LUAD中的表达数据及相关临床病理参数,并对HMG家族基因进行相关性分析。采用单因素Cox回归和LASSO Cox回归分析HMG基因家族与总生存期(OS)的关系,并构建HMG基因家族预后风险模型。根据风险评分中值将患者分为高风险组和低风险组,采用Kaplan-Meier进行生存分析。最后利用临床病理参数和风险评分构建预后列线图。结果HMGA1、HMGA2、HMGB2、HMGB3、HMGB4、HMGN1在LUAD中的表达量高于正常样本,HMGB1和HMGN5在LUAD中的表达量低于正常样本(均P<0.05),大多数HMG基因之间呈正相关,但HMGN3的表达与HMGA1、HMGA2呈负相关。4个HMG基因与OS相关(P<0.05),其中HMGA1、HMGA2、HMGB2是危险基因,HR>1;而HMGN3为保护基因,HR<1。Kaplan-Meier生存分析显示高风险组OS比低风险组OS更差(P<0.05)。低风险组和高风险组N、T和分期差异均有统计学意义(均P<0.05)。多因素Cox回归分析表明风险评分和分期是LUAD患者OS的独立影响因素(均P<0.05)。列线图可以系统预测LUAD患者1、3和5年的OS。结论HMG基因家族在LUAD发生和发展中起到重要作用,有望为LUAD预后标志物的筛选和预后评价提供参考。

关 键 词：肺腺癌 HMG基因家族 TCGA 预后 生物信息学 

分 类 号：R734.2[医药卫生—肿瘤]