高通量测序技术分析青海藏羊初乳和常乳微生物多样性  

作　　者：张莉莉 崔占鸿[1,2,3,4] 孙璐 刘书杰[1,2,3,4] 

机构地区：[1]青海大学畜牧兽医科学院,青海西宁810016 [2]农业农村部青藏高原放牧牦牛藏羊动物营养与饲草料重点实验室,青海西宁810016 [3]青海省牦牛工程技术研究中心,青海西宁810016 [4]青海省高原放牧家畜动物营养与饲料科学重点实验室,青海西宁810016

出　　处：《中国畜牧杂志》2023年第5期129-135,共7页Chinese Journal of Animal Science

摘　　要：为探究藏羊初乳和常乳的微生物组成及多样性,本试验选取体况良好、2~3胎次的藏羊6头,采集初乳(C)和常乳(OM)。基于高通量测序技术对2组乳样的16S rDNA的V4区进行分析,选用PICRUSt进行功能预测。结果显示:97%的一致性共得到3413个OTUs,微生物Alpha多样性指数在藏羊常乳中高于藏羊初乳(P<0.05)。变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)是2组乳样中丰度最高的2种菌门,藏羊初乳中2种菌门丰富度分别为77.61%和11.66%,常乳中为71.65%和17.43%。在属水平上,2组乳样的优势菌属均为假单胞菌属(Pseudomonas)、丛毛单胞菌属(Comamonas),且藏羊初乳中假单胞菌属和乳杆菌属(Lactobacillus)丰度高于常乳。16S rDNA基因KEGG水平功能预测,结果发现常乳在遗传信息处理、复制修复和翻译功能上得到显著富集,初乳在氨基酸代谢功能上得到显著富集。表明藏羊初乳和常乳微生物多样性存在显著差异,并发现常乳在遗传信息处理、复制修复和翻译功能上得到显著富集,初乳在氨基酸代谢功能上得到显著富集。

关 键 词：藏羊 初乳 常乳 微生物多样性 功能预测 

分 类 号：S826.2[农业科学—畜牧学]