硒都黑猪AOPEP基因SNP筛选鉴定及其与肌内脂肪含量的关联分析  

作　　者：周佳伟 杨涛[1,2] 张宇 吴俊静[1] 乔木[1] 徐忠[1] 李梓芃 冯越 彭先文 陈洪波[2] 梅书棋 

机构地区：[1]湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北武汉430064 [2]武汉轻工大学动物科学与营养工程学院湖北省家畜种业技术创新中心,湖北武汉430023

出　　处：《中国畜牧杂志》2023年第8期191-195,201,共6页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：国家重点研发计划项目(2022YFF1001300);国家自然科学基金项目(32102527);湖北省重点研发项目(2022BBA0018);湖北省科技重大专项项目(2022ABA002);湖北洪山实验室重大项目(2021hszd003)。

摘　　要：肌内脂肪(IMF)含量是影响猪肉风味的重要指标。本研究通过重测序方法筛选出影响猪IMF含量的SNP位点,并进一步利用SANGER测序法在硒都黑猪群体中筛选鉴定出猪AOPEP基因rs340610840、rs3470100435、rs34724762003个SNPs位点。通过关联分析发现这3个SNPs位点均与IMF含量显著相关,且3个SNPs位点紧密连锁,所构成的不同单倍型组合也与IMF含量显著相关。通过RNA稳定性分析发现,rs3470100435的C>A突变导致编码氨基酸由精氨酸变成甲硫氨酸,显著影响了AOPEP mRNA质心二级结构,且AOPEP蛋白与AGT、KRR1、LDLRAP1等10个蛋白存在相互作用。本研究发现了3个影响猪IMF含量的分子标记,且rs3470100435位点导致AOPEP mRNA二级结构发生变化,AOPEP可能与AGT和LDLRAP1蛋白互作,进而影响IMF性状。

关 键 词：猪 肌内脂肪含量 AOPEP基因 SNP 关联分析 

分 类 号：S828.2[农业科学—畜牧学]