芝麻产量相关性状全基因组关联分析  

Genome-wide association study on yield-related traits of sesame(Sesamun indicum L.)

作　　者：崔向华 隗正阳 杜振伟[2] 周霞丽 刘焱 石明权 阚跃峰 张少泽 崔承齐[2] 梅鸿献[2] Cui Xianghua

机构地区：[1]驻马店市农业科学院,河南驻马店463000 [2]河南省农业科学院芝麻研究中心,河南郑州450008 [3]南阳市农业科学院,河南南阳473085

出　　处：《江苏农业科学》2023年第21期106-113,共8页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家特色油料产业技术体系建设专项(编号:CARS-14-1-01、CARS-14-2-16);河南省重大科技专项(编号:201300110600);河南省中央引导地方科技发展资金(编号:Z20221343038);河南省农业科学院科技创新团队项目(编号:2023TD31);河南省农业科学院基础性科研工作项目(编号:2023JC13)。

摘　　要：以294份遗传多样性丰富的芝麻种质资源为试验材料,于2014年调查驻马店市、商丘市、南阳市3个地点的株高、始蒴高度、单株蒴数、蒴粒数、千粒质量、单株产量等6个产量相关性状,结合33 027个SNP标记,使用混合线性模型进行全基因组关联分析,对重复检测到的显著SNP位点两侧99 kb区域内挖掘所有功能注释基因,根据注释信息找寻与目标性状相关的基因,并进行功能富集分析。结果表明,6个性状存在广泛变异,3个环境下变异系数表现为单株产量和单株蒴数>始蒴高度>蒴粒数>千粒质量>株高。6个性状均呈现正态分布,广义遗传力为44.07%~85.49%。经关联分析共检测到171个显著关联位点,表型变异解释率为5.46%~11.56%。在驻马店和商丘共同检测到6个与蒴粒数显著关联的位点,在其侧翼各99 kb区域内共挖掘到118个功能注释基因,其中SIN_1012613基因与拟南芥CKI1(AT2G47430)是同源基因,该基因可能通过调控雌配子的发育来决定芝麻蒴粒数。本研究结果有助于解析芝麻产量相关性状的遗传机制,为芝麻产量的遗传改良奠定理论基础。

关 键 词：芝麻 产量性状 全基因组关联分析 SNP标记 功能注释基因 广义遗传力 候选基因预测 

分 类 号：S565.303.2[农业科学—作物学]