茶花鸡2号IFN-α基因克隆及生物信息学分析  

作　　者：刘琛 何永江 豆腾飞 杨明华[1] 潘洪彬[1] 赵素梅[1] 李永能[2] 黄英[1] 

机构地区：[1]云南农业大学动物科学技术学院/云南省动物营养与饲料重点实验室,云南昆明650201 [2]云南农业大学组织部,云南昆明650201

出　　处：《中国畜牧杂志》2024年第1期217-222,共6页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：云南省动物营养与饲料重点实验室开放基金(2021YNPKLANF005);国家蛋鸡产业技术体系昆明综合试验站(CARS-40-S25);云南省教育厅科学研究基金项目(2022J0291)。

摘　　要：本研究旨在克隆茶花鸡2号α干扰素基因(IFN-α)CDS区序列并进行生物信息学分析,为后续研究IFN-α基因对茶花鸡2号免疫功能的影响提供参考。以茶花鸡2号为实验对象设计IFN-α引物,提取总RNA,反转录PCR扩增并克隆其编码区序列,进行生物信息学分析。结果显示茶花鸡2号IFN-α基因CDS序列全长582 bp,IFN-α蛋白等电点5.05,平均疏水指数-0.514,为酸性亲水蛋白,且存在信号肽和1个跨膜区,主要定位于细胞核。IFN-α蛋白被4个N糖基化位点、5个O糖基化位点和20个磷酸化位点修饰,主要由α-螺旋与无规卷曲构成。茶花鸡2号与固始鸡、海兰鸡、惠阳胡须鸡、罗曼鸡和乌骨鸡的氨基酸同源性分别为95.9%、97.9%、97.9%、97.9%和95.9%。IFN-α蛋白与IRF7、IFNAR1、IFNAR2和IFNK等蛋白存在互作关系。本研究结果可为进一步探讨IFN-α基因在茶花鸡2号病毒疾病防治中的作用提供理论依据。

关 键 词：茶花鸡2号 IFN-α基因 基因克隆 生物信息学分析 

分 类 号：S831.2[农业科学—畜牧学]