宁乡猪不同生长阶段结肠微生物菌群特征分析  

作　　者：弯梦辽 付鑫琳 王芳 尹业鑫 谭名洋 肖银涛 陈家顺[1,2] 

机构地区：[1]湖南农业大学动物科学技术学院,动物营养基因组与种质创新研究中心,湖南长沙410128 [2]湖南省畜禽安全生产协同创新中心,湖南长沙410128

出　　处：《中国畜牧杂志》2023年第11期224-230,共7页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：“十四五”国家重点研发计划项目(2021YFD 1300403);国家生猪产业技术体系建设专项(CARS-35);湖南省自然科学基金青年基金项目(2022JJ40165);湖南省大学生创新创业训练计划项目。

摘　　要：本研究以宁乡花猪为实验对象,旨在通过16S rDNA高通量测序技术探究5个不同生长阶段(30、70、150、200、250日龄)结肠微生物菌群的结构及特征差异,分析各个阶段微生物组成及多样性。结果显示:宁乡猪结肠微生物多样性只在30日龄与200日龄间差异显著,而微生物丰度30日龄与70~250日龄间差异显著、70~150日龄与200日龄间差异显著;通过菌群分类学分析发现,在不同生长阶段结肠微生物菌群分布于23个门(Phylum)、41个纲(Class)、85个目(Order)、141个科(Family)、294个属(Genus);在门水平,厚壁菌门(Firmicutes)与拟杆菌门(Bacteroidota)为宁乡猪结肠微生物主要优势菌门,梭杆菌门(Fusobacteriota)与互养菌门(Synergistota)只存在于30日龄中;在属水平,乳酸杆菌属(Lactobacillus)、颤螺旋菌科(Oscillospiraceae_UCG_005)、普式菌属(Prevotella)、梭状芽孢杆菌属(Clostridium_sensu_stricto_1)、链球菌属(Streptococcus)为优势菌属;不同时期的特异菌群存在显著差异。LEfSe方法分析发现不同生长阶段肠道特异菌群不同,但含有较多如乳杆菌属(Lactobacillus)、柯林斯菌属(Collinsella)等有益菌。随着宁乡猪的生长发育,其肠道中厚壁菌门(Firmicutes)相对丰度的增加和拟杆菌门(Bacteroidota)相对丰度的降低与脂肪沉积相关;变形菌门(Proteobacteria)与梭杆菌门(Fusobacteriota)相对丰度的降低与致病性相关;放线菌门(Actinobacteriota)相对丰度的增加与能量摄取和利用相关,说明宁乡猪肠道菌群结构随生长发育阶段的改变而发生相应变化。

关 键 词：宁乡猪 结肠 不同生长阶段 微生物多样性 16S rDNA测序 

分 类 号：S828.5[农业科学—畜牧学]