薄片青冈叶绿体全基因组的特征及系统发育分析  

Characteristics and phylogenetic analysis of the complete chloroplast genome of Quercus lamellosa.

作　　者：李卜宇 黄婷 陈晓丽 何佳怡 唐梦 张雪梅[1] LI Buyu;HUANG Ting;CHEN Xiaoli;HE Jiayi;TANG Meng;ZHANG Xuemei

机构地区：[1]西华师范大学生命科学学院,四川南充637009

出　　处：《南方农业》2023年第23期1-7,共7页South China Agriculture

基　　金：华夏英才基金项目“米仓山自然保护区台湾水青冈种群更新机制研究”(463361)。

摘　　要：栎属(Quercus)青冈亚属(subgenus Cyclobalanopsi)的薄片青冈(Quercus lamellosa),是一种具有较高经济和生态价值的高大乔木,可用于营造用材林、园林美化、水土保持等。为有助于该物种的分子鉴定、遗传多样性和系统发育研究,开展了叶绿体基因组测序分析。首次报道了薄片青冈叶绿体基因组全序列:整个叶绿体基因组长度为160 928 bp,总GC含量为37.97%;由大的单拷贝(LSC,90 276 bp),小的单拷贝(SSC,18 902 bp)和一对反向重复(IRs,每个25 875 bp)组成。该基因组共预测到133个基因,其中包括8个核糖体RNA基因、38个转移RNA基因和87个蛋白质编码基因。此外,发现薄片青冈叶绿体基因组中高频密码子的第三个碱基偏向A/U,且自然选择对薄片青冈叶绿体基因组密码子偏好性的影响较大。共检测到113个简单重复序列(SSR)和38个长重复序列。系统发育分析显示,薄片青冈最先从青冈亚属分支中分化出来,是青冈亚属植物中较为原始的物种。

关 键 词：栎属 薄片青冈 叶绿体基因组 系统发育分析 

分 类 号：S718.43[农业科学—林学]