云上黑山羊11号染色体单倍型构建及与产羔性状的关联性分析  

作　　者：朱兰 江炎庭 欧阳依娜 涂兴调 赵小红 兰蓉 

机构地区：[1]云南省畜牧兽医科学院,云南昆明650224 [2]云南立新羊业有限公司,云南弥勒650000

出　　处：《中国畜牧杂志》2024年第2期202-207,214,共7页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：国家自然科学基金项目(31960654)。

摘　　要：为挖掘新的云上黑山羊高繁品系选育分子标记,研究选取前期GWAS分析获得的位于11号染色体上2个与产羔性状潜在关联位点附近区段内的103个SNPs进行单倍型构建,并与产羔性状进行关联分析。结果显示:位点rs26823728上下31 028 376~32 965 139 bp区段内构建出3个单倍型块(b1、b2、b3)11种单倍型,位点rs268284511上下47 008 354~48 991 484 bp区段内构建出6个单倍型块(d1、d2、d3、d4、d5、d6)21种单倍型;关联分析结果表明,单倍型d1-GG、d2-AA与第2胎产羔数有极显著关联,对该性状具有上调作用,而单倍型d2-TG与第2胎产羔数也有极显著关联,但对该性状具有下调作用;单倍型d6-AGCA与第2胎产羔数关联显著,对该性状具有上调作用,而单倍型d6-AGCC与平均胎产羔数关联显著,对该性状具有下调作用。综上,本研究从云上黑山羊11号染色体上筛选出4个与产羔性状显著关联的单倍型、8个位点并注释到SMYD1、RMND5A、GNLY、SFTPB和USP39 5个基因上。

关 键 词：云上黑山羊 11号染色体 单倍型 产羔性状 关联分析 

分 类 号：S827.2[农业科学—畜牧学]