基于生物信息学分析受体酪氨酸磷酸酶U对胃癌免疫微环境的影响  

The impact of receptor tyrosine phosphatase U on the immune microenvironment of gastric cancer based on bioinformatics analysis

作　　者：宋坤 林云霄 葛祖荫 王天工 邱江峰 郝敬铎 SONG Kun;LIN Yunxiao;GE Zuyin

机构地区：[1]宁波市镇海区人民医院,宁波315020 [2]上海交通大学附属仁济医院

出　　处：《现代实用医学》2024年第3期298-300,F0003,共4页Modern Practical Medicine

基　　金：浙江省医药卫生科技计划项目(2019KY626、2020KY894)。

摘　　要：目的分析TCGA数据库中胃癌数据集,探讨受体酪氨酸磷酸酶U(PTPRU)对胃癌免疫微环境的影响。方法获取TCGA数据库中胃癌的RNA-seq数据集,共提取33对配对样本。使用R语言的Limma包分析差异基因,并使用CIBERSORT算法评估胃癌样本中的免疫微环境组成。结果胃癌组织中PTPRU基因表达升高,且与人表皮生长因子受体2(HER-2)基因表达升高具有较高的相关性。通过CIBERSORT算法进一步评估胃癌样本中免疫微环境发现,B细胞、辅助性T细胞及T细胞调节细胞的浸润深度均升高(均P<0.05),单核细胞的浸润深度下降(P<0.05)。结论PTPRU的高表达可能通过抑制微环境中的免疫细胞功能,引起胃癌的发生发展。

关 键 词：受体酪氨酸磷酸酶U 胃癌 肿瘤免疫微环境 

分 类 号：R735.2[医药卫生—肿瘤]