西北农林科技大学小麦多组学数据库的构建与应用  被引量:1

Construction and Application of Wheat Multiomics Database at Northwest A&F University

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作  者:路田 刘子辉[1,2] 赵鹏 邱四春[1,2] 王晓明 郑炜君 韩德俊 毛虎德[1,2] 宋卫宁 陈新宏[1,2] 奚亚军 王中华 吉万全[1,2] 康振生 许盛宝[1,2] LU Tian;LIU Zihui;ZHAO Peng;QIU Sichun;WANG Xiaoming;ZHENG Weijun;HAN Dejun;MAO Hude;SONG Weining;CHEN Xinhong;XI Yajun;WANG Zhonghua;JI Wanquan;KANG Zhensheng;XU Shengbao(College of Agronomy(Academy of Agricultural Sciences),Northwest A&F university,Yangling Shaanxi 712100,China;State Key Laboratory of Crop Stress Biology for Arid Areas,Northwest A&F University,Yangling Shaanxi 712100,China;College of Plant Protection,Northwest A&F University,Yangling Shaanxi 712100,China)

机构地区:[1]西北农林科技大学农学院,陕西杨凌712100 [2]西北农林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点实验室,陕西杨凌712100 [3]西北农林科技大学植保学院,陕西杨凌712100

出  处:《西北农业学报》2024年第6期1019-1028,共10页Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica

基  金:TaGSK对小麦侧根发育的调控(CSBAA202210)。

摘  要:本研究在大规模根系转录组分析的基础上,获得406份全球遗传多样性丰富的小麦种质的基因型数据,并通过对18个农艺性状在10个种植环境中的系统调查,获得对应的表型数据。实验室前期评估证实表型与基因型数据可靠,可应用于小麦研究。同时,整合基因型、转录组、表型与栽培环境的气象数据,建立了一个可在网站(https://iwheat.net/resource)自由下载与利用的小麦多组学数据库,为小麦功能基因的挖掘与机理研究提供支持。Based on the analysis of large scale root system transcriptome.406 wheat genotype data with global genetic diversity were collected.The investigation encompassed 18 agronomic traits across in 10 planting environments.A reliable wheat multi-omics database was created by integrating genotype,transcriptome,phenotype,and meteorological data of planting environments,accessible at https://iwheat.net/resource.The database facilitates functional gene exploration and mechanism research in wheat.

关 键 词:小麦 多组学 数据库 基因型 表现型 

分 类 号:S512.1[农业科学—作物学]

 

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