子痫前期差异表达基因的筛选和生物信息学分析  

作　　者：宋红红 

机构地区：[1]丰县人民医院妇科,江苏徐州221700

出　　处：《吉林医学》2024年第7期1618-1622,共5页Jilin Medical Journal

摘　　要：目的:筛选子痫前期胎盘组织差异表达基因并行生物信息学分析,探索子痫前期的发生机制。方法:在基因表达综合数据库中筛选出GSE10588、GSE25906和GSE74341三个数据集,GEO2R法筛选出子痫前期组和正常妊娠组胎盘组织的差异表达基因,使用DAVID数据库对其进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,通过STRING网站及Cytoscape软件构建蛋白质的相互作用(PPI)网络并进行可视化,筛选关键基因。结果:共筛选出255个差异表达基因,其中120个基因表达上调,135个基因表达下调。进一步筛选出前10个关键基因:RHOA,CXCR4,RPL7A,RPL6,CXCL12,MRPS12,PLEC,MAPK1,DDX5,ITGB1。GO分析显示,在生物学过程组中,基因主要富集于细胞黏附、细胞分化、趋化因子、细胞迁徙等;在细胞组分组中,基因主要富集于黏着斑、外泌体、细胞黏附等;在分子功能组中,基因主要富集于细胞黏附。KEGG通路富集分析提示基因主要富集于白细胞迁徙、趋化因子信号通路、血小板激活、黏着斑等。结论:本研究通过生物信息学方法发现细胞黏附、细胞骨架、外泌体、趋化因子等因素参与子痫前期的发生,为子痫前期发生机制的进一步研究和药物靶点、标志物的筛选提供了基础。

关 键 词：子痫前期 妊娠期高血压 生物信息学分析 差异表达基因 蛋白质互作网络 

分 类 号：R714.244[医药卫生—妇产科学]