蛋白质互作网络

作品数：53被引量：56H指数：3
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相关领域：医药卫生生物学更多>>
相关作者：王靖郭政李霞陈铭马文财更多>>
相关机构：哈尔滨医科大学首都医科大学华中农业大学上海交通大学更多>>
相关期刊：《中国老年学杂志》《生物信息学》《赣南医科大学学报》《医学理论与实践》更多>>
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基于图神经网络的中药聚类方法研究
《世界科学技术-中医药现代化》2024年第11期2988-2995,共8页何佳怡 谢佳东 胡晨骏 胡孔法 
国家自然科学基金委员会面上基金项目(82074580):基于知识图谱的现代名老中医诊治肺癌用药规律及其机制研究,负责人:胡孔法;国家科学技术部国家重点研发计划重点专项课题(2022YFC3502302):全身望诊形态信息智能采集分析关键技术与装备,负责人:胡孔法;江苏省教育厅江苏省研究生科研创新计划(KYCX22_2054):基于知识图谱的名老中医诊治肺癌的用药机制研究,负责人:何佳怡。
目的本研究提出了一种基于图神经网络的中药聚类方法(CHM-GCNK),旨在从生物分子网络层面发现潜在的中药配伍。方法首先,收集中药、靶点(蛋白质)信息以及它们之间的相互作用关系,构建中药靶点网络。其次,采用图神经网络学习所构建的中药...
关键词：图神经网络 蛋白质互作网络 分子生物学 中药聚类 
基于网络拓扑分析识别非小细胞肺癌的关键基因
《赣南医科大学学报》2024年第9期873-879,共7页葛泳 吴泽童 程桉桉 杨文武 张洁 肖剑虹 陈丹丹 李红东 
赣南医学院校级课题(ZR2213)。
目的:通过分析非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC)的差异基因蛋白质互作网络和加权基因共表达网络,挖掘NSCLC潜在的生物标志物。方法:从公共数据库收集3套NSCLC的表达谱数据集为研究对象,首先利用NSCLC中发生差异表达的基...
关键词：癌 非小细胞肺 蛋白质互作网络 加权共表达网络 功能富集 生存分析 
子痫前期差异表达基因的筛选和生物信息学分析
《吉林医学》2024年第7期1618-1622,共5页宋红红 
目的:筛选子痫前期胎盘组织差异表达基因并行生物信息学分析,探索子痫前期的发生机制。方法:在基因表达综合数据库中筛选出GSE10588、GSE25906和GSE74341三个数据集,GEO2R法筛选出子痫前期组和正常妊娠组胎盘组织的差异表达基因,使用DA...
关键词：子痫前期 妊娠期高血压 生物信息学分析 差异表达基因 蛋白质互作网络 
基于基因共表达网络分析氧诱导小鼠视网膜新生血管模型免疫相关靶基因被引量：1
《国际眼科杂志》2024年第6期857-863,共7页袁琳慧 刘新 
2023年度大连市第三人民医院科研启动专项基金计划(No.2023ky002)。
目的:通过生物信息学方法探究氧诱导小鼠视网膜新生血管(OIR)模型中与免疫相关的关键基因以及免疫细胞浸润水平。方法:从GEO数据库获取基因芯片数据集,采用R语言环境中“limma”包获得差异表达基因(DEGs),并进行GO功能富集和KEGG通路分...
关键词：氧诱导视网膜新生血管 生物信息学 免疫浸润 蛋白质互作网络 差异基因 免疫细胞 小鼠 
基于系统生物学方法筛选癫痫潜在风险基因
《航天医学与医学工程》2024年第2期91-98,共8页郭盼 张殊悦 王学韬 蔡春泉 
目的利用生物信息学方法综合分析癫痫相关基因,从网络和通路的角度探讨其主要功能,并提取疾病关键基因。方法通过OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库以及文献检索收集癫痫相关基因,利用“ClusterProfiler”R包进行基因本体论(GO)和通路富...
关键词：癫痫 功能富集 生化通路 蛋白质互作网络 
基于生物信息学和机器学习算法鉴定桥本甲状腺炎的关键基因
《中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生》2024年第3期0106-0109,共4页罗安强 李俊红 
桥本甲状腺炎是最常见的自身免疫性疾病之一,具有遗传易感性。本研究的目的是确定桥本甲状腺炎的关键基因。方法:本研究整合了4套来自GEO的甲状腺组织数据集。随机森林(RandomForest)及支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)鉴定桥本甲状腺...
关键词：桥本甲状腺炎 差异表达基因 加权基因共表达网络分析 蛋白质互作网络 
牛HSPA6蛋白特性分析及蛋白互作网络构建被引量：1
《食品科学》2024年第3期1-8,共8页胡丽筠 马旭华 李亚蕾 罗瑞明 
国家自然科学基金地区科学基金项目(32160535);宁夏回族自治区重点研发项目(2017BY068)。
通过构建牛热休克蛋白A6(heat shock protein A6,HSPA6)序列与其他生物的系统进化树,以及运用生物信息学方法分析牛HSPA6蛋白的基本理化性质、亲疏水性等,并结合蛋白互作网络,探究牛HSPA6基因编码蛋白的结构和功能特性。结果显示,牛HSPA...
关键词：牛 热休克蛋白A6 结构特点 功能特性 蛋白质互作网络 
基于加权基因共表达网络识别糖尿病视网膜病变与免疫相关的关键基因
《国际眼科杂志》2023年第8期1343-1351,共9页袁琳慧 张立军 刘新 祁媛媛 
目的:通过生物信息学的方法探究糖尿病视网膜病变(DR)中免疫相关的关键基因以及免疫细胞的浸润情况。方法:2022-09/10从GEO数据库获取基因芯片数据集,采用“limma”R包获得差异表达基因(DEGs),并进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,基于C...
关键词：糖尿病视网膜病变 生物信息学 加权共表达 免疫浸润 蛋白质互作网络 差异基因 免疫细胞 
基于生物信息学探究系统性硬化-系统性红斑狼疮重叠综合征的病理机制
《中国免疫学杂志》2023年第5期1023-1028,共6页蒋志行 潘智新 代欣竹 刘冬梅(指导) 
国家自然科学基金青年科学基金(81501408)资助。
目的:通过生物信息学方法寻找系统性硬化(SSc)和系统性红斑狼疮(SLE)的分子联系,探究SSc-SLE重叠综合征的病理机制。方法:从DisGeNET数据库下载两种疾病相关基因,选取存在互作的基因构建蛋白互作网络,提取该网络中最大的连接成分作为子...
关键词：重叠综合征 系统性硬化 系统性红斑狼疮 分子机制 蛋白质互作网络 功能富集分析 
基于蛋白质互作网络的COVID⁃19对肺动脉高压的影响机制
《生物信息学》2022年第3期195-202,共8页杨子云 蒋婷婷 葛春光 贾晓东 刘清发 王琪 彭兰博 兰菲 齐军 
山东省自然科学基金项目(No.ZR2019QH009)。
通过构建肺动脉高压差异基因和冠状病毒侵入人体后免疫反应相关基因的互作网络,探索COVID⁃19对肺动脉高压的影响机制。首先通过Meta分析挖掘肺动脉高压相关差异表达基因;其次通过SARS⁃CoV侵染人体后的基因表达数据,挖掘主要功能通路;最...
关键词：肺动脉高压 新型冠状病毒 蛋白质互作网络 基因 通路 
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