稻米蒸煮食味品质的全基因组关联分析及遗传解析  

Genome wide association analysis and genetic dissection of rice cooking and eating quality

作　　者：林艳[1] 林旻 陈在杰[1] 顾建强[1] 潘雷博 陈光伟 胡昌泉[1] Lin Yan

机构地区：[1]福建省农业科学院生物技术研究所/福建省农业遗传工程重点实验室,福建福州350001 [2]福建农林大学生命科学学院,福建福州350002

出　　处：《江苏农业科学》2024年第12期34-44,共11页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：福建省属公益类科研院所基本科研专项(编号:2020R1027001);5511协同创新工程项目(编号:XTCXGC2021002)。

摘　　要：随着人们生活水平的提高,对稻米品质的要求越来越高,蒸煮食味品质逐渐成为水稻育种家的重要育种目标与工作难点。对稻米蒸熟食味品质相关性状的遗传解析、探索基于优异单倍型组合是改善、提升水稻蒸煮食味品质的基础。考察收集的199份华南优质稻直链淀粉含量、蛋白质含量、碱消值、食味值、蒸煮食味值等5个稻米蒸煮食味品质性状,结合全基因组测序(覆盖深度20×)所得4818707个单核苷酸多态性(SNP),用混合线性模型进行稻米蒸煮食味品质的全基因组关联分析。结果表明,共定位到显著性位点342个,其中5个为已克隆的与蒸煮食味品质相关的候选基因/QTL,包括调节稻米中直链淀粉含量的基因Du3、Flo2、OsSSI、Wx与控制稻米糊化温度的主效基因ALK。针对极显著关联的ALK与Wx基因功能变异位点,结合水稻基因组序列变异数据库RiceVarMap开展功能单倍型分析,发现Wx基因的Hap2(T)、ALK基因的Hap3(CAC)有利于提高稻米的蒸煮食味品质。研究结果可为利用优质单倍型组合提高稻米蒸煮食味品质的水稻分子设计育种研究提供理论参考。

关 键 词：蒸煮食味品质 全基因组 关联分析 单倍型 遗传解析 

分 类 号：S511.01[农业科学—作物学]