上海交通大学医学院附属新华医院发表外周血全基因组甲基化谱助力PURA相关神经发育异常疾病诊断和机制研究成果  

出　　处：《上海交通大学学报（医学版）》2024年第7期906-906,共1页Journal of Shanghai Jiao tong University:Medical Science

摘　　要：2024年5月17日,上海交通大学医学院附属新华医院临床遗传中心余永国团队在Genet in Medicine杂志发表研究论文“Genome-wide epigenetic signatures facilitated the variant classification of the PURA gene and uncovered the pathomechanism of PURA-related neurodevelopmental disorders”。该研究对23例携带PURA基因变异的神经发育障碍(PURA-NDD)患者进行了基因型-表型分析,同时应用全基因组甲基化芯片对其中17例患者外周血DNA进行了检测和分析,发现了一些之前未被报道的新表型。同时,全基因组DNA甲基化分析揭示了PURA-NDD独特的甲基化谱,发现携带PURA单倍剂量不足变异和错义变异的患者具有相似的DNA甲基化特征,通过机器学习建立的分类模型帮助3例携带PURA意义不明错义变异重新分类为致病变异。进一步体外实验结果显示,PURA错义变异与截短变异的细胞均显示Pur-α表达下调,表明存在共同的单倍剂量不足机制。该研究首次建立了PURA-NDD的甲基化谱,可以帮助识别和诊断不典型PURA-NDD患者,体现了其在遗传疾病诊断中的价值。

关 键 词：新华医院 疾病诊断 遗传疾病 DNA甲基化 全基因组甲基化 机器学习 体外实验结果 

分 类 号：R338[医药卫生—人体生理学]