丫杈猪生长发育、胴体及肉质性状全基因组关联分析  

作　　者：王言 顾以韧[1] 梁艳[1] 杨雪梅[1] 杨跃奎[1] 吕学斌[1] 龚建军[1] 陈晓晖[1] 应三成[1] 曾凯[1] 雷云峰[1] 陶璇[1] 何志平[1] 

机构地区：[1]四川省畜牧科学研究院,动物遗传育种四川省重点实验室,四川成都610066

出　　处：《中国畜牧杂志》2024年第8期239-243,共5页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：国家重点研发项目(2021YFD1301101);四川省重点研发项目(2021YFYZ0030、2020YFN0147);天府农业大师项目(He zhiping 2022);国家现代农业产业技术体系(CARS-35);现代农业产业技术体系四川生猪创新团队(sccxtd-2023-08);四川省财政专项(SASA2024CZYX001)。

摘　　要：本研究旨在通过对丫杈猪生长发育、胴体及肉质性状的全基因组关联分析(Genome Wide Association Study,GWAS),挖掘与丫杈猪生长发育、胴体和肉质性状相关的遗传标记和功能基因。以166头丫杈猪为试验材料,通过提取耳组织DNA并采用中芯一号芯片进行单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)检测,采用Plink(V1.90)对获得的基因型数据进行质控,利用GEMMA软件的混合线性模型对质控结果进行生长发育、胴体和肉质性状相关的GWAS分析。结果表明,有1个SNP与日增重在全基因组范围内显著相关,1个SNP与肌内脂肪含量在全基因组范围内显著相关,3个SNPs与瘦肉率在全基因组范围内显著相关,TOX3、DLG5和FAM180A、KIF2B分别是影响丫杈猪日增重、肌内脂肪含量和瘦肉率性状的候选基因。本研究结果为丫杈猪的分子育种提供了一定的理论参考价值。

关 键 词：丫杈猪 全基因组关联分析 生长发育性状 候选基因 

分 类 号：S828.8[农业科学—畜牧学]