赤水乌骨鸡线粒体DNA控制区遗传多样性和进化分析  

作　　者：吴芸[1] 李盼盼 闫吉美[1] 杨凤 黄锡阳 

机构地区：[1]遵义师范学院生物与农业科技学院,贵州遵义563006 [2]赤水市农业农村局畜牧渔业站,贵州赤水564700

出　　处：《中国畜牧杂志》2024年第10期127-132,共6页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：遵义师范学院“乡村振兴专项”项目(黔教合KY字[2012]017-17号)。

摘　　要：为探究赤水乌骨鸡线粒体DNA控制区的遗传多样性、单倍型特征和母系起源情况,利用PCR扩增和直接测序法检测了63只赤水乌骨鸡线粒体DNA (mitochondrial DNA, mtDNA)控制区(D-loop)全序列,分析其遗传多样性和单倍型特性,并与不同红色原鸡亚种的序列进行聚类分析。结果表明,赤水乌骨鸡mtDNA D-loop区全序列共检测到29个突变位点,构成19种单倍型。遗传多样性分析表明,单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(K)分别为0.990 5±0.018 0、0.006 5±0.000 5和7.981。系统发育分析显示,赤水乌骨鸡19种单倍型可划分为A、B、C、E、G 5个单倍型群,A、B均分别与原鸡滇南亚种聚类,单倍型群C与原鸡印度亚种、原鸡滇南亚种和原鸡海南亚种聚为一类,E单倍型群分支与印度亚种和原鸡滇南亚种聚为一类。据此推测,赤水乌骨鸡遗传多样性丰富,可能有多个母系起源,主要源于原鸡滇南亚种。

关 键 词：赤水乌骨鸡 MTDNA 控制区 遗传多样性 系统进化 

分 类 号：S831.2[农业科学—畜牧学]