基于整合分析基因表达数据筛选急性胰腺炎中差异表达基因  

作　　者：曾春艳[1,2] 李俊 陈幼祥[1] 

机构地区：[1]南昌大学第一附属医院消化内科 [2]江西省中西医结合医院消化内科,南昌330006

出　　处：《南昌大学学报（医学版）》2024年第5期81-87,共7页Journal of Nanchang University：Medical Sciences

基　　金：江西省卫健委科技计划项目(20203104,2019A046)。

摘　　要：目的了解急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)的生物学和分子发病机制,为预防和治疗AP提供依据。方法从基因表达总库数据库获取基因表达数据集GSE109227、GSE3644和GSE65146,其中包括AP小鼠和对照小鼠胰腺样本的基因表达谱。使用GEO2R鉴定所有差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并使用基因本体(gene ontology,GO)和京都基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析进行注释。结果在GSE109227、GSE3644和GSE65146数据集中发现38个共同的DEGs,将其构建成1个蛋白质-蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI)网络,确定了枢纽蛋白,并提取了功能模块。通过PPI网络分析确定参与粘连接头通路的3个基因(Cdh1、Iqgap1和Actn4),可能为AP的诊断和治疗提供潜在的生物标志物。结论Cdh1、Iqgap1和Actn4基因对AP的发生和发展有影响,这可能为AP的诊断和治疗提供新的靶点。

关 键 词：急性胰腺炎 差异表达基因 GO和KEGG分析 蛋白质-蛋白质相互作用 生物标志物 

分 类 号：R-3[医药卫生] R576