基于转录组测序分析沙门氏菌感染对番鸭法氏囊的影响  

Effects of salmonella infection on bursa of Fabricius in Muscovy ducks based on transcriptome sequencing

作　　者：徐文娟[1] 陶志云[1] 朱春红[1] 宋卫涛[1] 刘宏祥[1] 章双杰[1] 王志成 王逸飞 李慧芳[1] Xu Wenjuan

机构地区：[1]江苏省家禽科学研究所,江苏扬州225125

出　　处：《江苏农业科学》2024年第22期179-185,共7页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目(编号:JBGS[2021]111);江苏省现代农业(水禽)产业技术体系建设专项(编号:JATS[2023]365);国家家养动物种质资源库项目(编号:2023)。

摘　　要：为探讨沙门氏菌感染对番鸭的影响,拟通过转录组测序技术分析沙门氏菌感染番鸭后不同时间法氏囊组织的转录调控。利用肠炎沙门氏菌感染14 d雏番鸭,感染后1、3、10 d采集试验组和对照组法氏囊组织样本,提取RNA,利用Illumina测序平台进行测序,通过生物信息学分析鉴定不同时间点转录组变化、信号通路和功能。结果表明,在番鸭感染沙门氏菌1、3、10 d分别发现9、97、4个差异基因(P<0.05,|log 2 fold change|>1)。GO分析结果表明,3个时间点中这些差异基因在生物学进程、分子功能、细胞部分均有富集。KEGG分析结果表明,感染1 d时,差异基因主要富集于集合管的酸分泌、霍乱弧菌感染、癌症通路中;感染3 d时,差异基因主要富集于代谢信号通路、脂肪细胞脂解的调控及IgA产生的肠道免疫网络;感染10 d,差异基因主要富集在亨廷顿舞蹈症、肌萎缩侧索硬化症、多种疾病的神经退行性途径。其中,沙门氏菌感染1 d的差异基因ATP6V0A4,沙门氏菌感染3 d的差异基因IL-15、PTGS2、IGHV3-23主要参与了这些信号通路,提示这些基因可能在番鸭沙门氏菌感染过程中发挥重要作用。

关 键 词：沙门氏菌 番鸭 法氏囊 转录组测序 

分 类 号：S858.32[农业科学—临床兽医学]