高、低体细胞数新疆褐牛可变剪接事件及差异基因分析  

作　　者：闫梦婕 王丹[1] 马盛超 张涛[1] 张梦华[1] 黄锡霞[1] 

机构地区：[1]新疆农业大学动物科学学院,新疆乌鲁木齐830052

出　　处：《中国畜牧杂志》2025年第1期157-167,共11页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：“十四五”国家重点研发计划项目课题(2021YFD1200903)。

摘　　要：可变剪接(Alternative Splicing,AS)是一种调控机体转录本、蛋白质多样性的分子机制,参与机体的病理、生理反应过程,因其剪接位点的不同产生异常的转录本,由此产生病理状态。为了研究不同体细胞数(Somatic Cell Count,SCC)的新疆褐牛基因水平的表达差异,利用RNA-seq对High SCC、Low SCC的新疆褐牛血液中的差异表达基因/差异可变剪接基因进行筛选,并进行生物信息学分析。结果显示:High vs Low组中,共筛选到332个差异表达基因(245个上调,87个下调),这些基因主要与炎症反应、免疫反应、NF-κB信号通路、趋化因子信号通路等相关;针对可变剪接事件分析发现,389个差异可变剪接基因参与抗原处理和呈递、细胞粘附分子、趋化因子信号通路等重要通路,结合PPI结果进一步筛选到可能参与乳房感染的关键基因(CXCL2、TNF、IL-1β、IL-10、CD4等)。本研究结果为乳房炎抗性相关分子标记的开发提供了数据支撑。

关 键 词：RNA-SEQ 体细胞数 可变剪接 新疆褐牛 

分 类 号：S823.2[农业科学—畜牧学]