基于重测序数据的猪繁殖性状全基因组关联分析  

作　　者：吕玲燕 林昌华[2,3] 张胜斌 覃秀珍 柏秀芳 吴永绍 陈钊 刘磊 孙如玉 张冰[1] 张家庆 

机构地区：[1]广西农业职业技术大学畜牧研究院,广西南宁530007 [2]广西大学动物科学技术学院,广西南宁530004 [3]广西农垦永新畜牧集团西江有限公司,广西贵港537100 [4]河南省农业科学院畜牧研究所,河南郑州450002

出　　处：《中国畜牧杂志》2025年第1期235-241,共7页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：国家重点研发项目(2021YFD1301200);广西农业科技自筹经费项目(Z2022115);河南省科技攻关计划项目(242102111030);广西农业职业技术大学校级课题(XKJ2336);广西农业科技自筹经费项目(Z2023101)。

摘　　要：为从全基因组水平上探究影响母猪繁殖性状的分子机理,本试验对连续3胎不同产仔数的母猪进行全基因组重测序及关联分析,挖掘参与调控母猪高低产仔数性状的关键调控基因。本试验选取高繁母猪21头,低繁母猪19头,采用illumina novaseq 6000 PE150平台对40个文库进行全基因组重测序,结合母猪连续3胎产仔数的表型性状,基于GLM混合线性模型,并利用质控后的14708672个SNP标记进行全基因组关联分析。结果表明:总产仔数性状有87个SNP达基因组水平显著,候选基因包括RORA、SFRP1、HSD17B1、IGF_(1);产活仔数性状有73个SNP达基因组水平显著,候选基因包括DAZL、STAT3;健仔数性状有66个SNP呈基因组水平显著,候选基因包括DAZL、HSD17B1、STAT3;根据基因功能注释推测IGF_(1)、DAZL、HSD17B1、SFRP1、STAT3是繁殖性状的重要候选基因。本研究为猪繁殖性状的基因组选择提供了重要的理论基础。

关 键 词：重测序 猪 繁殖性状 全基因组关联分析 

分 类 号：S828.2[农业科学—畜牧学]