泉州市15株百日咳鲍特菌分离株基因组特征  

Genomic characteristics of 15 isolates of Bordetella pertussis from Quanzhou City

作　　者：龚彩婷[1] 彭艳兰[1] 林满芳[1] 郑友限[1] GONG Caiting;PENG Yanlan;LIN Manfang

机构地区：[1]泉州市疾病预防控制中心(福建医科大学附属泉州市疾病预防控制中心),福建泉州362000

出　　处：《海峡预防医学杂志》2024年第5期57-60,共4页Strait Journal of Preventive Medicine

摘　　要：目的对百日咳鲍特菌分离株进行全基因组测序及生物信息学分析,探讨其分子遗传变异特征,为百日咳防控提供依据。方法收集泉州市2024年1-5月百日咳鲍特菌分离株15株进行全基因组测序,用https://bigsdb.pasteur.fr/bordetella/对菌株进行多位点序列分型(MLST)、BPagST、T3SStype分析,并与我国的百日咳鲍特菌疫苗株CS株以及TohamaⅠ菌株进行基因序列对比分析,用基于核心基因组单核苷酸多态性(core-SNPs)进行测序数据基因SNP提取及系统发育树构建。结果15株百日咳鲍特菌菌株抗原基因型主要型别为ptxP3/ptxA1/ptxC1/prn1/fim2-1/fim3-1/tcfA2;MLST分型均为ST-2型,T3SStype为3型,未检测到红霉素耐药基因23SrRNA A2047G发生突变。结论泉州市2024年百日咳鲍特菌分离株主要为ST-2型,主要抗原基因分型为ptxP3/ptxA1/ptxC1/prn1/fim2-1/fim3-1/tcfA2。应加强百日咳鲍特菌监测,为百日咳的临床诊断和治疗策略制定提供分子生物学依据。

关 键 词：百日咳鲍特菌 基因测序 抗原基因 临床诊断 

分 类 号：R378.4[医药卫生—病原生物学]