沙子岭猪与大约克夏猪背最长肌miRNA-mRNA共调控网络分析  

作　　者：刘晓林 许栋 刘付穗 陈文武 王开明 肖镧林 陈博赫 易磊 刘财洪 刘静雯 徐信 付显创 马海明[1,2] 邓秋纯 

机构地区：[1]湖南农业大学动物科学技术学院/岳麓山实验室,湖南长沙410128 [2]农业农村部畜禽资源(猪)评价利用重点实验室,湖南长沙410128 [3]岳阳职业技术学院生物环境工程学院,湖南岳阳414000

出　　处：《国外畜牧学(猪与禽)》2025年第1期44-49,共6页Animal Science Abroad-Pigs and Poultry

基　　金：生物育种-国家科技重大专项(项目编号:2023ZD0406);云南省科技和平台人才计划(项目编号:202305AF150211)。

摘　　要：微小核糖核酸(micro RNA,mi RNA)是一类非编码核糖核酸(ribonucleiacid,RNA)小分子,长度约为22个核苷酸。本研究对沙子岭猪和大约克夏猪背最长肌组织表达谱芯片和转录组数据进行分析,旨在揭示这两个猪种的mi RNA与信使RNA(messengerRNA,m RNA)的差异表达特征及其调控网络。试验通过小RNA测序共鉴定出307个mi RNA,其中9个显著差异表达(5个上调,4个下调),并分别在沙子岭猪和大约克夏猪中鉴定出4个和5个特异性mi RNA;转录组分析显示鉴定出553个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中341个上调,212个下调。整合分析发现8个差异表达mi RNA(differentially expressed miRNAs,DEMs)与59个DEGs形成70对调控关系,构建了关键共调控网络。基因本体论(geneontologo,GO)富集分析表明,靶基因显著参与肌肉收缩调控、脂肪酸氧化等生物过程;京都基因和基因组数据库(Kyoto encyclopediaofgenesandgenomes,KEGG)通路分析揭示丝裂原活化蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase,MAPK)信号通路、Fox O(Forkhead box O,FoxO)信号通路和铁死亡等代谢调控途径的显著富集,其中MAPK14基因同时参与内分泌抵抗与免疫调控,ACOX1基因在丙酸和碳代谢中发挥双重作用。这些发现系统解析了沙子岭猪与大约克夏猪肌肉组织在电生理特性、能量代谢和分子调控水平的关键差异,为解析猪种质特性形成的分子机制提供了新见解。

关 键 词：背最长肌 MIRNA芯片 Solexa测序沙子岭猪 约克夏猪 

分 类 号：S813.1[农业科学—畜牧学]